泰州地区手足口病肠道病毒柯萨奇A16的VP1基因特征分析

摘要

1509份采集自在2010-2013年间泰州地区的手足口病肠道病毒中,共有453份为肠道病毒柯萨奇A16.而在2011年第一季度至2013年第一季度之间,观察到柯萨奇A16在泰州地区出现了一次聚集性爆发.而通过对柯萨奇A16毒株VP1基因的分子系统学的分析,发现在泰州地区新出现的一个柯萨奇A16的进化亚群与本轮聚集性爆发有关联,根据该亚群系统进化枝推测出的有效种群规模的变化趋势与柯萨奇A16实际的百分比变化趋势很像,而更为重要的是,发现该亚群中的所有毒株都在其VP1编码蛋白的23位发生了亮氨酸到甲硫氨酸的突变.