相同来源HIV-1 Env、Gag基因序列变异和宿主基因多态性与疾病进展关系的分析

摘要

目的 探讨HIV-1基因序列变异和宿主基因多态性与疾病进展的关系.方法 PCR方法从外周血细胞中扩增HIV-1 Env、Gag区片段和测序,分析序列变异、糖基化,超突变等指标.RFLP法确定宿主基因多态性.结果 未治疗组中,env基因区PCR和克隆序列平均离散率分别为0.1和0.06,差异有统计学意义,治疗组内差异没有统计学意义.V3环顶端序列在未治疗和治疗组中均以GPGQ比例最大(61.5%和39%),治疗组出现稀有多肽序列如GPGH、GQGR、GLGR、12位I/V和21位Y/H变异与疾病快速进展相关.Env区段上进展较快速组(RRP)比典型进展组(TP)的糖基化程度高(平均值分别为14.56和13.20个),差异有统计学意义.Env区段上REP比TP组GA取代百分率和绝对数平均值都高(8.7%/6.9%和10.1/7.6),差异也有统计学意义.TP组中SDF1-3'A和CCR2 V621基因频率均高于RRP组,但差异没有统计学意义.CX3CR1 V249I/M280T与疾病快速进展没有显著相关性.结论 V3区序列主要位点的氨基酸变异、Env区段糖基化程度、GA取代与疾病进展相关.SDF1-3'A、CCR2 V64I和CX3CR1 249I/280M与疾病进展均无显著相关性.