对含未知基因型个体的家系进行单倍型推断的EM方法

摘要

单倍型推断在现代连锁分析和关联分析中起着非常关键的作用.目前的单倍型推断方法基本上是根据基因型去推断个体的单倍型,而实际家系中某些个体的基因型经常是有部分缺失或者足完全未知的.本文给出了当家系中含有部分缺失或者完全缺失基因型个体时的单倍型推断的EM方法,并且给出了参数估计的标准差,最后通过模拟研究证实了我们的方法的可行性.