小双节RNA病毒阳性腹泻患儿粪便标本的病毒宏基因组学分析

摘要

目的研究小双节RNA病毒（PBVs）与儿童不明原因腹泻的关系。方法2015年1－12月于徐州市中心医院临床微生物检验中心为采样地点，筛选PBV反转录-PCR阳性的6岁以下腹泻患儿粪便样本作为研究组，同时从幼儿园采集4例正常儿童粪便样本作为对照组。利用病毒宏基因组学方法对上述样本进行分析，探讨PBVs与儿童腹泻的关系。对分离的PBV序列中RdRp行进化分析，进一步探讨PBVs分型与儿童腹泻的关系。结果7例腹泻儿童粪便样本含有高浓度的PBV序列，而阴性对照组只有1例含有低浓度的PBV序列，其他3例不含PBV序列。对分离到的PVB序列中RdRp进行分析，7个RdRp序列分别来源于7例粪便标本，分别命名为ChXz-1至ChXz-7。根据预测的RdRp的氨基酸序列与GenBank中已知的RdRp序列进行进化分析，提示7例PVB序列从属于3个不同的基因型，ChXz-1、ChXz-2、ChXz-3从属于基因型Ⅰ，ChXz-4、ChXz-5、ChXz-7属于基因型Ⅱ，ChXz-6属于基因型Ⅲ。结论PVBs可能是导致儿童腹泻的病原体之一，且3型PVBs均有可能导致腹泻的发生。