大白猪和莱芜猪肌内脂肪组织circRNAs的鉴定与分析

摘要

旨在探索circRNAs在脂肪组织可能发挥的潜在作用,为了解circRNA调控脂肪沉积和脂代谢作用的机制奠定基础.本研究采用RNA-Seq和生物信息学方法鉴定大白和莱芜猪肌内脂肪组织中circRNAs的表达情况,运用miRanda和Targetscan对差异表达circRNA进行靶基因预测,对靶基因进行GO和KEGG富集分析.结果发现,181个差异表达circRNAs得到鉴定,其中,102个在莱芜猪肌内脂肪组织中上调表达,79个下调表达.并对具有较多miRNA结合位点的ssc_ circ_ 0002807、ssc_circ_0009352靶基因进行了GO和KEGG富集分析,发现靶基因富集于胆固醇平衡和磷脂平衡等与脂代谢相关的生物学过程.通过qRT-PCR,验证了ssc_circ_0002807、ssc_circ_0005382、ssc_ circ_0009172和ssc_ circ_0004824,与测序结果一致.由此推断,ssc_circ_0002807与ssc_ circ_0009352可能参与调控脂肪沉积和脂质代谢.