贵州黑山羊DQB2基因Exon1遗传变异分析

摘要

研究了贵州黑山羊MHC-DQB2基因的多态性,以便发挥MHC-DQB2基因在山羊抗病育种中的作用.采用构建DNA池并通过PCR直接测序的方法对164只贵州黑山羊的DQB2基因Exon1进行遗传变异分析;应用生物信息学软件分析基因频率、RNA二级结构、蛋白质二级结构和抗原表位.在其第1外显子中筛选得到4个SNPs,分别为G23A(Arg→Gln)、G45A(同义突变)、T90C(同义突变)、C109A(Gln→Lys),其中,T90C突变位点的最小自由能最低,其RNA二级结构最稳定.G23A和C109A 2个突变位点均引起RNA二级结构、蛋白质二级结构和抗原表位的改变.结果表明:贵州黑山羊MHC-DQB2基因的第1外显子具有较丰富的遗传多样性.