乳腺癌细胞中microRNA作用机制的系统生物学分析

摘要

目的 从系统生物学的角度探讨miRNA与乳腺癌的发病机制的关系.方法 应用转录组测序技术分析人正常乳腺上皮细胞(HMEC)及乳腺癌细胞(MCF7)的转录组,建立差异表达miRNA和差异表达基因的调控关系,对差异表达miRNA调控的基因进行通路富集分析.结果 发现456个差异表达miRNA,其中上调表达217个,下调表达239个;发现4566个差异表达基因,其中上调表达2710,下调表达1856;建立了包含16554个miRNA对靶基因的调控关系网络;获得由hub基因和hub miRNA构成的乳腺癌基因调控核心网络;被调控的差异基因富集于64条通路上.结论 hsa-miR-19a-3p与hsa-miR-30c-5p等hub miRNA靶向CBX5和POU2F等hub基因与乳腺癌的生成密切相关;PI3K-Akt与细胞基因粘连等通路在乳腺癌的基因调控机制中起着重要作用.