日粮和饲料转化率对奶牛瘤胃液中细菌群落适应性变异的影响

摘要

由于对瘤胃细菌群落结构和活性认识方面的局限,使我们不能够很好理解群落动态变化对功能菌群和宿主生产力的影响。本研究结合公牛的日粮差异和剩余采食量(RFI),利用PCR-DGGE和定量RT-PCR两种方法鉴定与宿主生产力相关的特殊菌群。对55头公牛首先饲喂低能量浓度日粮然后转喂高能量浓度日粮,并采集瘤胃液进行PCR-DGGE分析。通过多元统计分析对细菌群落形态进行比较,结果表明在高能量日粮组与RFI相关的细菌簇上有种趋势。将属于同种日粮同一RFI组的牛鉴定与其饲料转化效率相关的特殊菌群,同时也对干物质采食量、平均日增重和Succinivibrio sp的16SrRNA基因的拷贝数之间的关系进行检测。Robinsoniella sp.与RFI在高能量日粮组中有显著差异(P<0.05),只在高能量日粮组中,RFI组间在Eu-bacterium sp.上才有显著差异(P<0.05)。本研究为解释特殊菌群是如何影响饲料转化效率最终影响宿主生产力提供了一个综合的框架,这可能是依赖或独立于日粮因素。