副猪嗜血杆菌丝氨酸蛋白酶基因的克隆及生物信息学分析

摘要

为研究副猪嗜血杆菌(Haemophilus parasuis,Hps)丝氨酸蛋白酶(espP)作为疫苗候选抗原的可能性,根据GenBank中Hps espP基因(登录号:HAPS_1381)设计引物,以Hps血清11型(H456)菌株的DNA为模板,PCR扩增目的基因并测序.将该基因核苷酸序列翻译成氨基酸序列后,对Hps espP蛋白的信号肽、亲水性区域和B细胞抗原表位进行预测,并预测了该蛋白C端的3D结构.结果显示,Hps espP基因序列全长2 343 bp,共可编码781个氨基酸,其中氨基酸序列的1 23位预测为信号肽.Hps espP蛋白含有12个亲水性区域,并预测含有12个B淋巴细胞抗原表位.构建Hps espP蛋白3D结构显示,该蛋白C端是由12个β折叠层围成的桶状结构.本试验为进一步研制新型副猪嗜血杆菌Hps espP蛋白多肽疫苗奠定基础.