EGF对hAMSCs基因表达谱影响及生物信息学分析

摘要

目的 探讨表皮生长因子(EGF)对人羊膜间充质干细胞(hAMSCs)基因表达谱影响及分子机制.方法 采用基因表达谱测序(Illumina RNA-Seq)技术和生物信息学分析方法,对100 ng/mL EGF干预前后的hAMSCs基因表达测序比对,确定hAMSCs基因表达谱,RT-PCR检测进行验证.结果 筛选出差异表达基因104个(FDR≤0.001和|log2 Ratio|≥1),其中上调差异表达基因56个,下调差异表达基因48个；GO生物学过程富集分析26个生物学过程具有显著性差异(P≤0.05)；KEGG信号通路富集分析细胞因子与细胞因子相互作用信号通路具有显著性差异(Q≤0.05),RT-PCR检测验证与基因表达谱结果一致.结论 EGF干预hAMSCs引起基因表达谱的变化,显著差异表达的基因和信号通路可能在hAMSCs增殖和迁移及促进创伤修复过程中具有重要作用.