转化生长因子β对人肾小管上皮细胞全基因表达谱的影响及其生物信息学分析

摘要

目的 本研究探讨转化生长因子-β(TGFβ)对人肾小管上皮细胞(HK-2)基因表达谱的影响及相关生物信息学分析,为深入探讨和研究TGF-β对肾功能的影响及作用机制提供理论依据和实验基础.方法 将体外培养的HK-2细胞随机分为正常对照组和TGF-β诱导组,培养48 h后取出,运用Illumina测序平台检测TGF-β对HK-2细胞基因表达谱的影响,并采用DAVID数据库对差异表达的基因(mRNA)进行其富集的GO功能和基于KEGG数据库的生物通路富集分析.实时定量RT PCR用于验证基因表达谱结果.结果 TGF-β处理HK-2细胞48h后,基因测序分析筛选出表达差异＞1.5倍的基因共279个,其中上调121个,下调158个,包括钙离子结合、脂质代谢、细胞黏附、血管钙化、炎症反应等相关的基因.RT-PCR验证结果基因测序分析结果一致.结论 TGF-β可能通过多条通路调控肾小管上皮的功能.