丹参4-(5′-二磷酸胞苷)-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶的cDNA全长克隆及其诱导表达分析

摘要

本文首次从丹参毛状根中克隆得到了丹参4-(5′-二磷酸胞苷)-2-C-甲基-D-赤藓醇激酶(简称为SmCMK)的编码基因的全长cDNA序列,GenBank注册号:EF534309.KEGG软件分析表明:SmCMK位于二萜类化合物生物合成的上游途径--非甲羟戊酸途径(DXP),是DXP途径上唯一的激酶.所克隆的SmCMK基因序列全长1 493 bp,包括完整的开放阅读框(open readingframe,ORF),推测编码396个氨基酸的多肽,分子质量为43.302 kDa,等电点(pI)值为6.78;含有71 bp的5′非转译区(5′ UTR)和232 bp的3′非转译区(3′ UTR).末尾具有完整的AATAA加尾信号和PolyA结构,说明所克隆基因的序列较为完整.经序列比对分析表明,SmCMK与其他植物CMK激酶家族具有较高的同源性.实时荧光定量PCR结果显示该基因受茉莉酸甲酯(MJ)诱导后表达水平显著升高,与丹参酮类成分含量受MJ诱导后的增加趋势一致,初步证明了SmCMK基因表达量与丹参酮类成分的积累之间的关系,为进一步研究丹参酮类成分的次生代谢调控机制奠定了基础.