16S rRNA及rpoC1基因用于螺旋藻、节旋藻系统发育的比较

摘要

[目的]利用16S rRNA和rpoC1基因分子标记研究螺旋藻、节旋藻的系统发育关系,并对其区分能力进行比较.[方法]以84株螺旋藻、节旋藻为研究对象,对其进行16S rRNA、rpoC1基因序列的扩增、测序及分析,并对构建的系统发育树进行对比.[结果]rpoC1基因序列保守位点所占比例49.7％、平均G+C百分含量47.7％和序列相似度76％-100％明显低于16S rRNA基因序列的79.4％、55.6％和91％-100％,其变异程度高于16S rRNA基因;基于16S rRNA、rpoC1基因构建的系统发育NJ树拓扑结构基本一致,84株实验藻株分为2个属3个类群,其中仅F-351、F-904-2、F-1070和TJBC14-1藻株为螺旋藻,其余均为节旋藻;虽然2个基因都不能区分形态种和地理种,但rpoC1基因NJ树的置信度(100％)高于16SrRNA基因(99％),属内分群效果也明显优于16S rRNA基因.[结论]支持了螺旋藻、节旋藻为两个不同属的结论,且在属内分类时rpoC1基因比16S rRNA基因具有更高的区分度.