茶树CsCIGR基因克隆及表达特性分析

摘要

该研究以茶树基因组数据库为基础,采用RT-PCR技术,从茶树‘龙井43’中克隆得到基因CsCIGR.序列分析显示,CsCIGR基因开放阅读框长度为1 677 bp,编码588个氨基酸.进化分析表明,CsCIGR属于GRAS家族的PAT1亚家族.多序列比对显示,茶树CsCIGR蛋白与其他植物的GRAS蛋白氨基酸序列具有很高的相似性.氨基酸理化性质分析显示,CsCIGR转录因子属于亲水性蛋白.亚细胞定位预测显示,CsCIGR可能位于细胞核中.启动子预测分析发现,CsCIGR启动子区域包含胁迫响应元件(STRE)、干旱应答元件(MYC)、厌氧诱导元件(ARE)等多种与逆境响应相关的顺式作用元件.荧光定量PCR分析结果显示,CsCIGR基因在低温(4℃)、高温(38℃)、干旱(200 g·L-1 PEG)、高盐(200 mmol·L-1 NaCl)胁迫下均能诱导表达,且对高盐,低温和高温胁迫响应更为明显,推测CsCIGR基因在茶树响应逆境胁迫中发挥重要作用.该研究为茶树抗性育种筛选基因提供了重要理论依据.