子痫前期、早产和正常足月胎盘组织的DNA甲基化组学研究

目录

声明

中英文缩略词对照表

1 引言

2 材料和方法

2.1 研究对象和伦理学声明

2.2实验设备、试剂和溶液配制

2.2.1 主要实验设备和仪器

2.2.2 主要实验试剂

2.2.3 主要溶液的配制

2.2.4 引物

2.3 实验方法

2.3.1 病例筛选和分组

2.3.2 胎盘组织标本采集

2.3.3 基因组DNA 提取

2.3.4 DNA 的重亚硫酸盐处理

2.3.5 Infinium HumanMethylation 850K Beadchip 全基因组检测

2.3.6 Infinium HumanMethylation850K Beadchip 甲基化芯片数据分析流程

2.3.7 焦磷酸测序

2.3.8 RNA 的提取和cDNA合成

2.3.9 实时荧光定量PCR（Quantitative Real-Time PCR, qRT-PCR）

2.4. 统计学方法

3 结果

3.1 胎盘组织的甲基化谱

3.1.1 研究对象的临床特征

3.1.2 样本相似度分析

3.1.3 差异甲基化位点（Differential methylated sites, DMSs）的筛选

3.1.4 差异甲基化区域（Differential methylated regions, DMRs）分析

3.1.5 差异甲基化基因的验证

3.1.6 差异甲基化基因的功能富集分析

4 讨论

4.1 Infinium HumanMethylation 850K Beadchip 的优势

4.2 研究对象的选择与分组依据

4.3 胎盘组织的DNA 甲基化水平与孕周相关

4.4 差异甲基化基因的表达与分析

4.4.1 胎盘组织中CMIP 基因的甲基化水平和表达水平分析

4.4.2 胎盘组织中BLCAP 基因的甲基化水平和表达水平分析

4.4.3 胎盘组织中MICA 基因的甲基化水平和表达水平分析

4.5 子痫前期甲基化研究的展望

5 结论

参考文献

综述:DNA甲基化在人类胎盘发育和子痫前期发病机制中的研究

参考文献

个人简历

致谢