玉米愈伤组织形成过程中非编码RNA的表达与调控

目录

声明

主要符号对照表

第一章 绪论

1.1 miRNA的研究进展

1.1.1 miRNA的合成

1.1.2 miRNA的生物学功能

1.1.3 miRNA及其靶标的研究方法

1.2 长链非编码RNA的研究进展

1.2.1 长链非编码RNA的概述

1.2.2 长链非编码RNA的生物学功能

1.2.3 长链非编码RNA的研究方法

1.3 玉米愈伤组织的研究进展

1.4 本研究的目的与意义

第二章 材料与方法

2.1 实验材料

2.2 数据分析方法

2.2.1 小RNA测序文库构建

2.2.2 降解组测序文库构建

2.2.3 转录组测序文库构建

2.2.4 小RNA测序数据预处理和miRNA的鉴定

2.2.5 miRNA的表达分析

2.2.6 miRNA的靶标鉴定

2.2.7 转录组数据分析

2.2.8 lincRNA的鉴定

2.2.9 特异表达lincRNA的鉴定

2.2.10 特异表达lincRNA的cis调控

2.2.11 特异表达lincRNA的共表达分析

2.2.12 miRNA靶向的lincRNA鉴定

第三章 结果

3.1 玉米愈伤组织形成过程中miRNA的鉴定与分析

3.1.1 小RNA测序数据基本分析

3.1.2 玉米愈伤组织形成过程中miRNA的鉴定

3.1.3 miRNA的表达变化分析

3.2 玉米愈伤组织形成过程中miRNA靶标的鉴定

3.2.1 降解组测序数据的分析结果

3.2.2 玉米愈伤组织形成过程中的转录组分析

3.2.3 mRNA靶标的表达及与miRNA表达的相关性

3.3 玉米愈伤组织形成过程中lincRNA的鉴定与分析

3.3.1 玉米愈伤组织中lincRNA的鉴定及其基本特征

3.3.2 特异表达lincRNA的鉴定

3.3.3 特异表达lincRNA的cis调控

3.3.4 特异表达lincRNA与诱导基因的共表达分析

3.4 玉米愈伤组织形成过程中miRNA与lincRNA调控关系的初步分析

第四章 讨论

4.1 生长素参与玉米愈伤组织的形成

4.2 miRNA在玉米愈伤组织形成中的作用

4.3 lincRNA在玉米愈伤组织形成中的作用

第五章 结论

参考文献

附录A

其他工作：玉米愈伤组织形成过程中的m6A甲基化修饰分析

一、研究目的

二、结果

附录B

致 谢

作者简历