原生动物阴道毛滴虫组蛋白基因的结构与启动子分析

摘要

阴道毛滴虫是一种寄生的原生动物,真核生物的一条分支,它引起重要的性传播疾病毛滴虫病。因此,更好地理解阴道毛滴虫转录调控机制具有潜在的医疗上的应用价值。 阴道毛滴虫基因组草图的完成提供了一个很好的机会来研究组蛋白基因的结构和与表达相关的启动子的分析。分析阴道毛滴虫基因组显示大多数组蛋白基因呈头对头方向,形成基因对,但同时还有一些基因是单独分布在基因组上。这么多的组蛋白基因数据,为识别基因5'上游区域的顺式调控元件提供了便利。通过阴道毛滴虫组蛋白基因5'上游序列的比较,显示大多数组蛋白基因含有三个motif。不仅碱基组成保守,而且三个motif的相对位置也高度保守。 另外,本研究发现(1)三个motif主要出现在启动子区域；(2)motif I与Inr高度相似,Inr能介导阴道毛滴虫基因转录起点的选择；(3)25个与细胞循环相关的调节蛋白质基因的启动子区域都含有motif II。这些发现表明这三个元件很可能在基因转录调控中发挥着作用。

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致谢

第一章文献综述

引言

1.1阴道毛滴虫概述

1.1.1形态与生活史

1.1.2致病机制

1.1.3临床症状

1.1.4诊断

1.1.5防治

1.1.6阴道毛滴虫的基因组研究进展

1.2组蛋白概述

1.2.1组蛋白的基本结构

1.2.2组蛋白基因

1.3启动子结构

1.3.1原核生物启动子

1.3.2真核生物启动子

1.3.3阴道毛滴虫启动子

第二章材料与方法

2.1材料来源

2.2数据分析方法

2.2.1组蛋白基因的进化分析

2.2.2保守的序列元件

2.2.3 Motif出现频率的计算分析

第三章结果与分析

3.1阴道毛滴虫组蛋白基因间区域分析

3.2 Motif的logos图分析

3.3阴道毛滴虫组蛋白基因上游序列中三个motif的分布

3.4 Motif Ⅱ与细胞周期有关

3.5阴道毛滴虫组蛋白基因的系统发育分析

3.6保守序列motif的计算分析

3.7其它原生动物保守的motif

第四章讨论

第五章总结与展望

参考文献

附录

作者简历