EGR1和LAMA2基因多态性与中国汉族高度近视的关联研究

摘要

目的:
　　基于全基因组关联分析及动物模型结果，选择早期生长反应蛋白1（Early GrowthResponse-1，EGR1）和层粘连蛋白α2（lamininα2，LAMA2）基因作为候选基因，探究其与中国汉族人群高度近视的关联性，为高度近视发病机制的揭示奠定基础。
　　方法:
　　选择EGR1和LAMA2基因序列中的标记位点:基于此前的遗传学研究及动物实验模型，选取早期生长反应蛋白1（Early Growth Response-1，EGR1）和层粘连蛋白α2（lamininα2，LAMA2）基因作为候选基因。我们在人类单倍型图谱计划（HapMap Project）数据库选取次要等位基因频率（Minor allele frequency, MAF）＞0.2，r2＞0.8适用于汉族人群的标记SNP(tSNP)用作连锁不平衡分析(Linkagedisequilibrium，LD)由此确定了了EGR1基因标记位点rs11743810和LAMA2基因标记位点rs2571575、rs9321170和rs9321170。高度近视候选基因EGR1和LAMA2的关联分析:收集132个高度近视核心家系，每个核心家系由患高度近视的子代和他们的双亲组成，以及191例散发高度近视患者和487例正常对照。记录屈光度数、眼轴长度(AXL)、角膜曲率(CP)和前房深度等参数。每位入选者抽取5ml静脉血提取血液DNA，采用polymerase chain reaction-ligase detection reaction(PCR-LDR)法测定rs11743810、rs2571575、rs9321170和rs9321170的基因型。随后采用FBAT(基于家系的关联分析法)及病例-对照关联分析法（Case-control）分析标记SNP(tSNP)与高度近视的关联性。
　　结果:
　　DNA序列分析显示EGR1和LAMA2基因所测的4个tSNP位点在高度近视及正常人群中无显著差异，FABT研究中4个tSNP基因型分布差异P值分别0.2216、0.6767、0.7738、0.7127，病例对照研究高度近视患者与对照组4个tSNP基因型分布差异P值分别为0.5641、0.8375、0.9947、0.8322。P值均大于0.05，无统计学差异。
　　结论:
　　EGR1的rs11743810位点和LAMA2的rs2571575、rs9321170和rs9321170及其单倍型与汉族人群高度近视发生发展无显著相关性。

目录

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致谢

摘要

1 引言

2 方法

2．1 选取中国汉族人EGR1和LAMA2基因序列中的tSNP位点

2．2 高度近视候选基因EGR1和LAMA2的关联分析

3 结果

3．1 PCR扩增

3．2 LDR法DNA测序结果

3．3 DNA测序重复性检验

3．4 病例对照及FBAT关联分析结果

4 讨论

4．1 EGR1基因的关联分析结果

4．2 LAMA2基因的关联分析结果

4．3 关于本研究的分析效能

4．4 展望

参考文献

综述 近视眼遗传机制的研究现状与展望

作者简历及在学期间所取得的科研成果