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生防木霉(Trichoderma guizhouense NJAU4742)重寄生分子机理研究Ⅰ——中性金属肽酶NMP1和活性氧的功能分析

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摘要

缩略语及专有词汇检索表

第一章 文献综述

1 土传病害真菌及防控

1.1 土传病害真菌的种类与表现

1.2 土传病害的成因

1.3 土传病害防治

2.生防木霉国内外研究概况

2.1 生防木霉菌的生物学特征和应用现状

2.2 生防木霉菌防治病害机制

2.3 生防木霉促生机制研究现状

2.4 真菌蛋白酶的研究进展和功能

3 丝状真菌的研究方法

3.1 正向遗传学方法

3.2 反向遗传学方法

3.3 基因打靶

4 研究目的、意义及技术路线

4.1 研究的目的和意义

4.2 研究技术路线图

第二章 Trichoderma guizhouense NJAU 4742鉴定与重寄生特征分析

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 筛选和纯化强寄生能力的木霉

2.2 染色分析NJAU 4742和Foc4的菌丝完整性

2.3 NJAU 4742挥发性气体抑制Foc4菌丝生长

2.4 NJAU 4742挥发性气体成分与抑菌效果

2.5 Foc4菌丝体诱导NJAU 4742分泌胞外水解酶

2.6 实时荧光定量PCR分析chil8-5、nag1和gluc78表达

2.7 贝叶斯进化分析NJAU 4742

2.8 比较NJAU 4742和CBS重寄生及代谢特征

2.9 光敏感性分析

3 讨论

4 小结

第三章 Trichoderma guizhouense NJAU 4742荧光蛋白标记及其定殖研究

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 分析NAJU4742对潮霉素敏感性

2.2 根癌农杆菌介导的NJAU 4742遗传转化体系的建立与优化

2.3 转化子的PCR和荧光检测

2.4 AMT体系在其他真菌中的推广应用

2.5 标记菌株NJAU 4741遗传稳定性、重寄生和Biolog分析

2.6 标记菌株NJAU474l在土壤和肥料中的定殖研究

2.7 标记菌株NJAU4741对土壤酶活的影响

2.8 标记菌株NJAU 4741定殖植物根际与促生研究

3 讨论

4 小结

第四章 Trichoderma guizhouense NJAU 4742重寄生突变菌株的筛选和分析

1.材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 比较野生型NJAU 4742和突变子NJAU 4743对镰刀菌的拮抗能力

2.2 突变子NJAU 4743丧失强拮抗多种植物病原真菌的活性

2.3 野生型NJAU 4742和突变子NJAU 4743菌丝代谢谱的比较

2.4 NJAU 4742和突变子NJAU 4743水溶性代谢产物的抑茵效果

2.5 T-DNA插入位点侧翼序列的克隆与分析

2.6 反转录PCR确定T-DNA插入位点的沉默基因

2.7 反向遗传学回补突变菌株

2.8 验证回复突变子NJAU 5307和NJAU 5308拮抗活性

2.9 测定NJAU4742不同生长阶段的nmpl表达

3 讨论

4 小结

第五章 Trichoderma guizhouense NJAU 4742中性金属肽酶NMP1异源表达与功能分析

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 NMP1序列比对分析

2.2 蛋白预测与结构分析

2.3 NMP1进化分析

2.4 基因nmp1酵母表达载体构建及转化

2.5 Western Blot分析酵母转化子发酵液

2.6 NMP1蛋白纯化与测序

2.7 粗酶液酶活

2.8 NMP1对病原真菌的拮抗能力测定与分析

2.9 测定对峙多种病原真菌中基因nmp1表达

3 讨论

4 小结

第六章 功能性分析活性氧在Trichoderma guizhouenseNJAU 4742重寄生过程的作用

1 材料与方法

1.1 材料

1.2 方法

2 结果与分析

2.1 分析菌丝表面黄色分泌物

2.2 间接分析对峙平板不同位置菌丝分泌的酶活和H2O2

2.3 原位检测NJAU4742对峙Foc4的平板上H2O2和O2·-

2.4 分析正丁醇提取液、粗酶液和H2O2对Foc4菌丝影响

2.5 植物病原真菌和NJAU 4742菌丝对H2O2敏感分析

2.6 NJAU 4742活性氧相关基因显著上调

2.7 基因nox1的敲除

2.8 NJAU 4742和△nox1突变子的菌丝形态差异

2.9 △nox1基因互补子及突变株的筛选及验证

2.10 过量表达nox1质粒转化与突变株的筛选

2.11 比较过量表达突变子和△nox1的重寄生能力

3 讨论

4 小结

参考文献

全文结论及展望

一、全文结论

二、展望

创新点

附录

博士期间已(待)发表的论文

会议摘要

致谢

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摘要

重寄生是指一种真菌捕食或者寄生另外一种真菌,获取营养,满足自身的生长繁殖;当被捕食的或被寄生的是植物病原真菌,可以抑制病原真菌的生长繁殖,达到生物防治植物真菌病害的效果。由尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种(Fusariumoxysporum f.sp.cubense4,Foc4)侵染引起的香蕉枯萎病(巴拿马病)是目前香蕉产业发展最为严重的限制因子。目前防控枯萎病的方法主要有化学杀菌剂和生物杀菌剂,而化学杀菌剂的大量使用会引发环境和食品质量问题,因此研究利用以生物杀菌剂为主导的综合防控具有重要意义。研究和应用最广泛的真菌杀菌剂是在根际有较强竞争能力的木霉(Trichoderma spp.),因为其能重寄生植物病原真菌,减轻真菌引起的病害;定殖植物根际,活化养分,促进植物生长,并能诱导植物提高对多种植物病原真菌的系统抗性(Induced Systemic Resistance,ISR),提高经济作物产量。目前生产应用中木霉菌剂主要有哈茨木霉(Trichoderma harzianum)、绿木霉(Trichoderma virens)和深绿木霉(Trichoderma atroviride)。但是由于木霉分子生物学研究起步晚,技术难度大,限制了木霉重寄生机理的研究进展。
  本研究筛选一株具有强重寄生能力的木霉NJAU4742,分析确定NJAU4742其在木霉菌中进化分类;通过优化农杆菌介导转化方法,荧光标记NJAU4742,跟踪其在土壤颗粒、肥料颗粒和植物根际的定殖;再通过构建T-DNA随机插入突变子库,筛选弱寄生能力的突变子,分析T-DNA在NJAU4742基因组的插入位点,确定插入位点基因的功能;最后,比较NJAU4742菌丝分泌的代谢组分的抑菌能力差异,结合相关功能基因的敲除与过量表达,确定NJAU4742重寄生植物病原真菌的重要因子。
  主要研究结果如下:
  1.筛选一株对植物病原真菌Foc4、灰葡萄孢菌、交链格孢菌、核盘菌、水稻恶苗病菌、立枯丝核菌和齐整小核菌有强寄生能力的NJAU4742,通过扫描电子显微镜(Scanning Electronic Microscopy, SEM)观察到NJAU4742菌丝能够缠绕或者紧贴Foc4菌丝生长。Trypan Blue染色确定NJAU4742的代谢产物在NJAU4742菌丝缠绕Foc4菌丝过程中破坏Foc4的菌丝结构。NJAU4742水溶性代谢产物能够抑制灰葡萄孢菌、交链格孢菌、核盘菌、立枯丝核菌和齐整小核菌的生长,但不能明显抑制Foc4菌丝延伸;GC-MS分析NJAU4742挥发性气体的成分,在封闭环境中,3-辛酮、萘、1-甲基萘和1-辛烯-3-酮均能抑制Foc4菌丝生长;测定NJAU4742的胞外水解酶的特征,确定灭活Foc4菌体能够诱导NJAU4742分泌几丁质酶、类胰蛋白酶和类糜蛋白酶。根据NJAU4742基因cal1、 chi18-5和tef1的序列,贝叶斯进化分析,确定NJAU4742在木霉属中分类位置,区别于模式菌株Trichoderma harzianum CBS226.95(CBS)的分支。比较NJAU4742和CBS的重寄生病原真菌的特异性和水溶性代谢产物的抑菌活性,避光条件下,CBS菌丝重寄生Foc4的能力较弱,其菌丝无法覆盖Foc4菌落,其水溶代谢产物抑制活力也弱。结合Biolog代谢谱分析,鉴定NJAU4742属于Trichoderma guizhouense。
  2.优化农杆菌介导转化NJAU4742分生孢子的方法,确立最佳的转化共培养温度、农杆菌与分生孢子共培养的载体和农杆菌类型,该方法被证实适用转化T.aggressivum CPK375、T.pleuroticola CPK2104、T.pleurotum CPK2094和Foc4,并有较高的转化效率。荧光标记NJAU4742,跟踪其在土壤和有机肥料颗粒表面定殖,利用突变子潮霉素B抗性,平板计数;盆栽实验证明,NJAU4742能够促进香蕉植株生长,提高抗病能力,并观察到NJAU4742成功定殖植物根际。
  3.通过农杆菌介导转化,T-DNA随机插入NJAU4742,构建突变子库,纯化得到80个突变子,筛选出一株特异突变子,其菌丝不能覆盖Foc4、灰葡萄孢菌和链格孢菌,水溶性代谢产物的抗真菌活性降低。HiTAIL-PCR确定T-DNA插入NJAU4742基因组中一个金属肽酶基因(编码MEROPS家族M35蛋白酶)的终止子,金属肽酶命名为nmp1。突变子回复突变,恢复野生型具有的重寄生能力。毕赤酵母表达NMP1,大小约18.7 kDa;分析蛋白结构,NMP1含有独特HEXXH motif,结合2个锌离子,另外GTXDXXYG motif结合第三个锌离子。纯化的NMP1不能抑制病原真菌的生长,但对峙平板中,NMP1能部分恢复突变子的重寄生齐整小核菌的能力,增强野生型NJAU4742重寄生能力。通过实时定量PCR,灭活Foc4菌丝,对峙中感应和接触病原真菌菌丝能够诱导NJAU4742 nmp1的表达。
  4.收集NJAU4742重寄生Foc4菌丝过程中菌丝表面形成的黄色液体,GC-MS分析其中化合物,鉴定为硬脂酸和棕榈酸。硬脂酸和棕榈酸是细胞膜组成成分,说明重寄生过程中,有菌丝被消化。分析液滴酶活,有较高的几丁质酶和蛋白酶,同时能检测出H2O2。比较NJAU4742粗酶液(Foc4菌丝诱导)、正丁醇提取物(溶解NJAU4742次级代谢产物)和H2O2对Foc4菌丝的抑制效果,确定H2O2有抑制活力。染色研究NJAU4742菌落对峙Foc4菌落过程中活性氧的变化,NJAU4742菌丝接触Foc4后,H2O2集聚。荧光定量PCR分析对峙Foc4过程中NJAU4742的Fe-sod, Mn-sod和Cu/Zn-sod(编码Superoxide Dismutase,SOD,功能是将O2·-氧化成H2O2)表达量提高。碘化丙啶染色表明10 mM H2O2处理Foc4萌发的孢子和菌丝,破坏细胞膜结构;PDA平板上,5mMH2O2能够部分抑制立枯丝核菌和齐整小核菌的生长,改变核盘菌、交链格孢菌和Foc4菌落形态。
  构建敲除nox1(编码NADPH oxidase1,Nox1)载体,PEG-CaCl2介导转化原生质体,得到410个突变子,通过PCR筛选出一株阳性转化子。转化子△nox1避光下失去野生型强寄生核盘菌、Foc4和齐整小菌核能力,同时伤害应激反应减弱。
  构建过量表达nox1载体,转化突变子△nox1,恢复野生型NJAU4742避光条件下强寄生核盘菌、Foc4和齐整小菌核的能力;转化野生型NJAU4742,定量PCR确定nox1转录水平,转化子较野生NJAU4742表现出更强的寄生能力。光照下,突变子能够重寄生核盘菌、齐整小菌核菌落、Foc4和灰霉病菌。
  结论:菌株NJAU4742有较强的重寄生多种植物病原真菌能力;适应能力强,能在土壤颗粒表面定殖;能利用有机肥料再次发酵,提高NJAU4742数量级。分析NJAU4742次级代谢产物中不同组分,确定H2O2是NJAU4742菌丝破坏Foc4菌丝的最重要的物质;Foc4菌丝体能够诱导分泌水解酶更,裂解菌丝满足NJAU4742菌丝的生长。

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