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摘要
第一章 绪论
1.1 卫生假说
1.1.1 概念
1.1.2 卫生假说与疾病
1.2 肠道微生物与疾病
1.2.1 免疫系统疾病
1.2.2 孤独症
1.3 肠道微生物与免疫系统发育
1.4 肠道微生物与神经系统发育
1.5 肠道微生物多样性的影响因素
1.5.1 饮食
1.5.2 分娩方式
1.5.3 其它因素
1.5.4 生活环境
1.6 肠道微生物多样性的研究方法
1.7 课题的目的和研究内容
1.7.1 研究目的
1.7.2 研究内容
1.8 本文的组织结构
第二章 不同清洁度条件下Balb/c小鼠免疫研究
2.1 实验材料
2.1.1 实验样本来源及饲养
2.1.2 主要试剂和耗材
2.1.3 DNFB溶液配制
2.1.4 主要实验仪器与设备
2.2 实验方法
2.2.1 小鼠体重测定
2.2.2 致敏试验
2.2.3 肠道各段样本采集
2.2.4 肠道各段样本细菌总DNA的提取
2.2.5 细菌基因组DNA电泳检测
2.3 实验结果
2.3.1 小鼠脾重、肝重、体重测定
2.3.2 小鼠血清IgE分析
2.3.3 小鼠盲肠内容物样本DNA提取结果
2.3.4 小鼠盲肠内容物样本DNA电泳检测结果
2.4 讨论
2.5 结论
第三章 MiSeq测序分析小鼠盲肠内容物微生物多样性
3.1 MiSeq测序及生物信息分析结果
3.1.1 OTU数量分析
3.1.2 五组样本群落多样性指数分析
3.1.3 门水平上的菌群结构分析柱状图
3.1.4 属水平上的菌群结构分析柱状图
3.1.5 属水平上的优势菌属分布分析
3.1.6 多样品群落结构相似度比对树状图
3.1.7 多样品群落结构相似度比对常规Heatmap图
3.1.8 群落差异比较
3.2 讨论
3.3 结论
第四章 总结
参考文献
致谢
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