声明
第1章 绪论
1.1 DNA甲基化
1.1.1 果实发育与DNA甲基化
1.1.2 5-azaC与DNA甲基化
1.1.3 MSAP分子标记与甲基化
1.1.4 ROS与甲基化
1.2 转录组测序
1.2.1 转录组测序与果实发育
1.2.2 WGCNA分析在转录组中的应用
1.3 本研究目的与内容
1.3.1 目的与意义
1.3.2 研究内容
第2章 材料与方法
2.1 材料及处理方法
2.2 生理指标测定
2.3 MSAP分析
2.3.1 DNA提取
2.3.2 MSAP分子标记分析
2.4 转录组分析
2.4.1 RNA提取、建库和转录组测序
2.4.2 转录组分析
2.4.3 基因聚类分析
2.4.4 WGCNA分析
2.4.5 荧光定量PCR
第3章 结果与分析
3.1 5-azaC处理后果实的发育状态
3.2 5-azaC对果实发育生理的影响
3.2.1 5-azaC对果实横径和硬度的影响
3.2.2 5-azaC对果实蔗糖和可溶性固形物含量的影响
3.2.3 5-azaC对果实花青素和MDA含量的影响
3.2.4 5-azaC对果实AsA含量和NOX活性的影响
3.2.5 5-azaC对果实H2O2含量和CAT活性的影响
3.2.6 5-azaC对果实SOD活性和O2-·产生速率的影响
3.3 MSAP分子标记分析
3.4 转录组分析
3.4.1 转录组测序数据分析
3.4.2 主成分分析
3.4.3 不同发育时期基因表达GO功能富集分析
3.4.4 处理与对照间基因表达模式的比较分析
3.4.5 差异表达基因分析
3.4.6 处理和对照间差异表达基因功能注释分析
3.4.7 WGCNA分析
3.4.8 荧光定量PCR
第4章 讨论
4.1 5-azaC处理对果实发育的生理影响
4.2 5-azaC处理对基因表达的影响
第5章 结论
参考文献
缩略语词汇表
附录Ⅰ 差异表达基因的KEGG通路富集分析
致谢
攻读学位期间的研究成果
