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Algorithms for Molecular Biology

中文名称：算法对分子生物学

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1.Effects of RNAi Silencing of SSIII Gene on Phosphorus Content and Characteristics of Starch in Potato Tubers

机译：RNAi沉默SSIII基因对马铃薯块茎磷含量和淀粉特性的影响。
- 作者：DU Hong-hui;YANG Tao;MA Cong-yu;FENG Dan;ZHANG Ning;SI Huai-jun;WANG Di
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 可溶性淀粉合酶;
- RNAi技术;
- 马铃薯块茎;
- I基因;
- 磷含量;
- 35S启动子;
- RT-PCR分析;
- 植物表达载体;
2.Effect of Semen vaccariae and Taraxacu mogono on Cell Adhesion of Bovine Mammary Epithelial Cells

机译：越橘和蒲公英对牛乳腺上皮细胞粘附的影响
- 作者：TONG Jin-jin;LI Ye;LIU Rong;GAO Xue-jun;LI Qing-zhang
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 细胞粘附分子;
- 乳腺上皮细胞;
- 王不留行;
- 奶牛;
- 精液;
- Western印迹法;
- β-catenin;
- 定量RT-PCR;
3.Toxicological Evaluation of Chicken-Breast Meat with High-Dose Irradiation

机译：大剂量辐照鸡肉对鸡的毒理学评价
- 作者：ZHU Jia-ting;FENG Min;YAN Jian-min;LIU Chun-quan;HAYi-ming;GAO Mei-xu;YANG Ping;WANG Zhi-dong;WANG De-ning;LI Shu-rong;GU Gui-qiang
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 毒理学评价;
- 鸡胸脯肉;
- 高剂量;
- 照射;
- Ames试验;
- 急性毒性;
- 胸肌;
- 半数致死剂量;
4.Effects of Papain Hydrolysis on the Pasting Properties of Wheat Flour

机译：木瓜蛋白酶水解对小麦粉糊化特性的影响
- 作者：CHEN Jian-sheng;TIAN Ji-chun;DENG Zhi-ying;ZHANG Ying-xiang;FENG Shou-li;YAN Zuo-chen;ZHANG Xin-ye;YUAN Hui-qing
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 木瓜蛋白酶;
- 蛋白酶水解;
- 糊化特性;
- 小麦面粉;
- 蛋白质网络;
- 时间处理;
- 淀粉糊化;
- 结构特性;
5.Estimates of N20 Emissions and Mitigation Potential from a Spring Maize Field Based on DNDC Model

机译：基于DNDC模型的春玉米田N20排放和减排潜力估算。
- 作者：LI Hu;QIU Jian-jun;WANG Li-gang;XU Ming-yi;LIU Zhi-qiang;WANG Wei
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- DNDC模型;
- 春玉米田;
- N20;
- 排放量;
- 估计;
- 中国东北地区;
- 氧化亚氮排放;
- 基础;
6.Biomass Components and Environmental Controls in Ningxia Grasslands

机译：宁夏草地生物量组成与环境控制
- 作者：WANG Kai-bo;LI Jian-ping;SHANGGUAN Zhou-ping
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 草原类型;
- 生物质组分;
- 环境控制;
- 宁夏;
- 草地生物量;
- 全球碳循环;
- 地下生物量;
- 年平均降水量;
7.Farmer＇s Knowledge on GM Technology and Pesticide Use： Evidence from Papaya Production in China

机译：农民对转基因技术和农药使用的了解：来自中国木瓜生产的证据
- 作者：HOU Lin-ke;HUANGJi-kun;WANG Xiao-bing;HU Rui-fa;XUE Chun-ling
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 番木瓜环斑病毒;
- 转基因技术;
- 农药使用量;
- 作物生产;
- 农民;
- 知识;
- 普通最小二乘法;
- 证据;
8.Journal of Integrative Agriculture

机译：综合农业学报
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 农业科学;
- 中西医结合;
- 中国;
- CAAS;
- 国际期刊;
- 同行评议;
- 学术期刊;
- ASC;
9.Identification of QTLs Associated with Total Soyasaponin Content in Soybean （ Glycine max （L.） Merr.）

机译：大豆总皂苷总含量相关QTL的鉴定
- 作者：HUANG Shan-shan;HAN Ying-peng;LI Chang-suo;TIAN Jun;LlWen-bin;WANG Ji-an
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 大豆皂甙;
- 皂甙含量;
- QTL;
- 分子标记辅助选择;
- 数量性状基因座;
- 鉴定;
- 定相;
- 结构;
10.Selection of Submergence Tolerant Homozygous Line by STS Marker and Twice Submergence Stress

机译：利用STS标记和两次淹没胁迫选择耐淹纯合系。
- 作者：LI Jin-jiang;XIAO You-lun;XIAO Guo-ying
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 淹涝胁迫;
- STS标记;
- 纯合系;
- 淹水;
- 孟德尔遗传规律;
- 核雄性不育系;
- 卡方检验;
- 农艺性状;
11.Genetic Analysis of Earliness Trails in Short Season Cotton （Gossypium hirsutum L.）

机译：短季棉（Gossypium hirsutum L.）早熟痕迹的遗传分析
- 作者：SONG Mei-zhen;FAN Shu-li;YUAN Ri-hong;PANG Chao-you;YU Shu-xun
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 遗传分析;
- 短季棉;
- 陆地棉;
- 双列杂交分析;
- 早熟性状;
- 上位性效应;
- 加性效应;
- 随机区组设计;
12.Evaluation of the Resistance of Different Tea Cultivars to Tea Aphids by EPG Technique

机译：EPG技术评价不同茶树品种对茶蚜的抗性
- 作者：LIANG Li-yun;LIU Li-fang;YU Xiao-ping;HAN Bao-yu
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- EPG技术;
- 茶树品种;
- 抵抗性;
- 茶蚜;
- 持续时间;
- 评价;
- 茶叶种植;
- 方差分析;
13.Induction of Apoptosis in the Immature Mouse Testes by a Mixture of Melamine and Cyanuric Acid

机译：三聚氰胺和氰尿酸的混合物诱导未成熟小鼠睾丸的凋亡
- 作者：YOU Hua;ZHU Jin-feng;SHE Rui-ping;CHANG Ling-ling;SHI Rui-han;DING Ye;CHI Li-juan;LIU Bin;YUE Zhuo;TIAN Ji-jing;MAO Jing-jing;SU Li-fang
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 小鼠睾丸;
- 三聚氰胺;
- 细胞凋亡;
- 混合物;
- Bcl-2;
- Bax;
- 诱导;
- 三聚氰酸;
- 成熟;
14.Price Transmission in China＇s Swine Industry with an Application of MCM

机译：MCM在中国养猪业的价格传递
- 作者：XU Shi-wei;LI Zhe-min;CUI Li-guo;DONG Xiao-xia;KONG Fan-tao;LI Gan-qiong
- 期刊名称：《农业科学学报：英文版》 | 2012年第012期
- 价格体系;
- 养猪业;
- MCM;
- 传导;
- 中国;
- 应用;
- 价格调整;
- 滞后效应;
15.Atom mapping with constraint programming

机译：约束编程的原子映射
- 作者：Martin Mann;Feras Nahar;Norah Schnorr;Rolf Backofen;Peter F Stadler;Christoph Flamm
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
16.Analysis of pattern overlaps and exact computation of P-values of pattern occurrences numbers: case of Hidden Markov Models

机译：模式重叠分析和模式出现次数P值的精确计算：隐马尔可夫模型的情况
- 作者：Mireille Régnier;Evgenia Furletova;Victor Yakovlev;Mikhail Roytberg
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
17.A priori assessment of data quality in molecular phylogenetics

机译：分子系统发育学数据质量的先验评估
- 作者：Bernhard Misof;Karen Meusemann;Bj?rn M von Reumont;Patrick Kück;Sonja J Prohaska;Peter F Stadler
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
18.Protein (multi-)location prediction: using location inter-dependencies in a probabilistic framework

机译：蛋白质（多）位置预测：在概率框架中使用位置相互依赖性
- 作者：Ramanuja Simha;Hagit Shatkay
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
19.Faster algorithms for RNA-folding using the Four-Russians method

机译：使用四俄罗斯方法进行RNA折叠的更快算法
- 作者：Balaji Venkatachalam;Dan Gusfield;Yelena Frid
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
20.Simplified sequence-based method for ATP-binding prediction using contextual local evolutionary conservation

机译：基于上下文局部进化保守的基于序列的简化ATP结合预测方法
- 作者：Chun Fang;Tamotsu Noguchi;Hayato Yamana
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
21.Predicting gene ontology annotations of orphan GWAS genes using protein-protein interactions

机译：使用蛋白质-蛋白质相互作用预测孤儿GWAS基因的基因本体注释
- 作者：Usha Kuppuswamy;Seshan Ananthasubramanian;Yanli Wang;Narayanaswamy Balakrishnan;Madhavi K Ganapathiraju
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
22.Identification of alternative topological domains in chromatin

机译：染色质中替代拓扑结构域的鉴定
- 作者：Darya Filippova;Rob Patro;Geet Duggal;Carl Kingsford
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
23.Fast algorithms for approximate circular string matching

机译：用于近似圆字符串匹配的快速算法
- 作者：Carl Barton;Costas S Iliopoulos;Solon P Pissis
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
24.A minimum-labeling approach for reconstructing protein networks across multiple conditions

机译：在多种条件下重建蛋白质网络的最小标记方法
- 作者：Arnon Mazza;Irit Gat-Viks;Hesso Farhan;Roded Sharan
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
25.Probabilistic approaches to alignment with tandem repeats

机译：与串联重复序列比对的概率方法
- 作者：Michal Nánási;Tomá? Vina?;Broňa Brejová
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
26.Characterizing compatibility and agreement of unrooted trees via cuts in graphs

机译：通过图形切割来表征无根树的兼容性和一致性
- 作者：Sudheer Vakati;David Fernández-Baca
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
27.Graph-distance distribution of the Boltzmann ensemble of RNA secondary structures

机译：RNA二级结构的玻尔兹曼合奏的图距分布
- 作者：Jing Qin;Markus Fricke;Manja Marz;Peter F Stadler;Rolf Backofen
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
28.MSARC: Multiple sequence alignment by residue clustering

机译：MSARC：通过残基聚类进行多序列比对
- 作者：Micha? Modzelewski;Norbert Dojer
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
29.Using the message passing algorithm on discrete data to detect faults in boolean regulatory networks

机译：在离散数据上使用消息传递算法检测布尔型监管网络中的故障
- 作者：Anwoy K Mohanty;Aniruddha Datta;Vijayanagaram Venkatraj
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
30.RNA-RNA interaction prediction using genetic algorithm

机译：基于遗传算法的RNA-RNA相互作用预测
- 作者：Soheila Montaseri;Fatemeh Zare-Mirakabad;Nasrollah Moghadam-Charkari
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
31.BicPAM: Pattern-based biclustering for biomedical data analysis

机译：BicPAM：用于生物医学数据分析的基于模式的双聚类
- 作者：Rui Henriques;Sara C Madeira
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
32.Using cascading Bloom filters to improve the memory usage for de Brujin graphs

机译：使用级联Bloom过滤器来改善de Bruijn图的内存使用量
- 作者：Kamil Salikhov;Gustavo Sacomoto;Gregory Kucherov
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
33.Assessing the efficiency of multiple sequence alignment programs

机译：评估多个序列比对程序的效率
- 作者：Fabiano Sviatopolk-Mirsky Pais;Patrícia de C Ruy;Guilherme Oliveira;Roney S Coimbra
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
34.On the number of genomic pacemakers: a geometric approach

机译：关于基因组起搏器的数量：一种几何方法
- 作者：Sagi Snir
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
35.Not assessing the efficiency of multiple sequence alignment programs

机译：不评估多个序列比对程序的效率
- 作者：Andrew E Torda
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
36.Enumerating all maximal frequent subtrees in collections of phylogenetic trees

机译：枚举系统发育树集合中的所有最大频繁子树
- 作者：Akshay Deepak;David Fernández-Baca
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
37.Segmentor3IsBack: an R package for the fast and exact segmentation of Seq-data

机译：Segmentor3IsBack：R包，用于对Seq数据进行快速准确的分段
- 作者：Alice Cleynen;Michel Koskas;Emilie Lebarbier;Guillem Rigaill;Stéphane Robin
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
38.Mutual enrichment in ranked lists and the statistical assessment of position weight matrix motifs

机译：排名列表中的相互充实和位置权重矩阵图案的统计评估
- 作者：Limor Leibovich;Zohar Yakhini
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
39.Optimal computation of all tandem repeats in a weighted sequence

机译：加权序列中所有串联重复序列的最佳计算
- 作者：Carl Barton;Costas S Iliopoulos;Solon P Pissis
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2014年第1期
40.Inferring interaction type in gene regulatory networks using co-expression data

机译：使用共表达数据推断基因调控网络中的相互作用类型
- 作者：Pegah Khosravi;Vahid H Gazestani;Leila Pirhaji;Brian Law;Mehdi Sadeghi;Bahram Goliaei;Gary D Bader
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
41.A two-phase binning algorithm using l-mer frequency on groups of non-overlapping reads

机译：在不重叠读取的组上使用l-mer频率的两阶段合并算法
- 作者：Le V Vinh;Tran V Lang;Le T Binh;Tran V Hoai
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
42.Fair evaluation of global network aligners

机译：公平评估全球网络调整者
- 作者：Joseph Crawford;Yihan Sun;Tijana Milenkovi?
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
43.A virtual pebble game to ensemble average graph rigidity

机译：一个虚拟的卵石游戏，可以使平均图形刚度达到整体
- 作者：Luis C González;Hui Wang;Dennis R Livesay;Donald J Jacobs
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
44.An online peak extraction algorithm for ion mobility spectrometry data

机译：离子迁移谱数据的在线峰提取算法
- 作者：Dominik Kopczynski;Sven Rahmann
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
45.Sorting signed permutations by short operations

机译：通过短操作对有符号排列进行排序
- 作者：Gustavo R Galv?o;Orlando Lee;Zanoni Dias
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
46.HIA: a genome mapper using hybrid index-based sequence alignment

机译：HIA：使用基于混合索引的序列比对的基因组作图仪
- 作者：Jongpill Choi;Kiejung Park;Seong Beom Cho;Myungguen Chung
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
47.An integrative approach for a network based meta-analysis of viral RNAi screens

机译：基于网络的病毒RNAi筛选的荟萃分析的综合方法
- 作者：Sandeep S Amberkar;Lars Kaderali
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
48.GAML: genome assembly by maximum likelihood

机译：GAML：通过最大可能性进行基因组组装
- 作者：Vladimír Bo?a;Broňa Brejová;Tomá? Vina?
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
49.Fast algorithms for computing sequence distances by exhaustive substring composition

机译：通过穷举子串合成来计算序列距离的快速算法
- 作者：Alberto Apostolico;Olgert Denas
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2008年第1期
50.Reconstructing phylogenies from noisy quartets in polynomial time with a high success probability

机译：在多项式时间内从嘈杂的四重奏重建系统发育的可能性很高
- 作者：Gang Wu;Ming-Yang Kao;Guohui Lin;Jia-Huai You
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2008年第1期
51.CHSMiner: a GUI tool to identify chromosomal homologous segments

机译：CHSMiner：识别染色体同源片段的GUI工具
- 作者：Zhen Wang;Guohui Ding;Zhonghao Yu;Lei Liu;Yixue Li
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
52.An asymmetric approach to preserve common intervals while sorting by reversals

机译：一种非对称方法，可在通过冲销排序时保留公共间隔
- 作者：Marília DV Braga;Christian Gautier;Marie-France Sagot
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
53.Modeling genetic imprinting effects of DNA sequences with multilocus polymorphism data

机译：使用多基因座多态性数据模拟DNA序列的遗传印迹效应
- 作者：Sheron Wen;Chenguang Wang;Arthur Berg;Yao Li;Myron M Chang;Roger B Fillingim;Margaret R Wallace;Roland Staud;Lee Kaplan;Rongling Wu
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
54.Lossless filter for multiple repeats with bounded edit distance

机译：具有无限制编辑距离的多次重复的无损滤波器
- 作者：Pierre Peterlongo;Gustavo AT Sacomoto;Alair P do Lago;Nadia Pisanti;Marie-France Sagot
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
55.A polynomial time biclustering algorithm for finding approximate expression patterns in gene expression time series

机译：用于寻找基因表达时间序列中近似表达模式的多项式时间双簇算法
- 作者：Sara C Madeira;Arlindo L Oliveira
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
56.Breaking the hierarchy - a new cluster selection mechanism for hierarchical clustering methods

机译：打破层次结构-用于层次结构聚类方法的新集群选择机制
- 作者：László A Zahoránszky;Gyula Y Katona;Péter Hári;András Málnási-Csizmadia;Katharina A Zweig;Gergely Zahoránszky-K?halmi
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
57.Grammatical-Restrained Hidden Conditional Random Fields for Bioinformatics applications

机译：用于生物信息学应用的语法约束隐藏式条件随机场
- 作者：Piero Fariselli;Castrense Savojardo;Pier L Martelli;Rita Casadio
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
58.An image processing approach to computing distances between RNA secondary structures dot plots

机译：一种计算RNA二级结构点图之间距离的图像处理方法
- 作者：Tor Ivry;Shahar Michal;Assaf Avihoo;Guillermo Sapiro;Danny Barash
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
59.Linear model for fast background subtraction in oligonucleotide microarrays

机译：寡核苷酸微阵列中快速背景扣除的线性模型
- 作者：K Myriam Kroll;Gerard T Barkema;Enrico Carlon
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
60.iTriplet, a rule-based nucleic acid sequence motif finder

机译：iTriplet，基于规则的核酸序列基序查找器
- 作者：Eric S Ho;Christopher D Jakubowski;Samuel I Gunderson
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
61.Ranking differentially expressed genes from Affymetrix gene expression data: methods with reproducibility, sensitivity, and specificity

机译：从Affymetrix基因表达数据中排序差异表达的基因：具有重现性，敏感性和特异性的方法
- 作者：Koji Kadota;Yuji Nakai;Kentaro Shimizu
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
62.Tracking cells in Life Cell Imaging videos using topological alignments

机译：使用拓扑比对跟踪生命细胞成像视频中的细胞
- 作者：Axel Mosig;Stefan J?ger;Chaofeng Wang;Sumit Nath;Ilker Ersoy;Kannap-pan Palaniappan;Su-Shing Chen
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
63.A linear programming approach for estimating the structure of a sparse linear genetic network from transcript profiling data

机译：一种线性编程方法，用于根据转录谱分析数据估算稀疏线性遗传网络的结构
- 作者：Sahely Bhadra;Chiranjib Bhattacharyya;Nagasuma R Chandra;I Saira Mian
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2009年第1期
64.Distinguishing between hot-spots and melting-pots of genetic diversity using haplotype connectivity

机译：利用单倍型连通性区分遗传多样性的热点和热点
- 作者：Binh Nguyen;Andreas Spillner;Brent C Emerson;Vincent Moulton
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
65.Refining transcriptional regulatory networks using network evolutionary models and gene histories

机译：使用网络进化模型和基因历史来完善转录调控网络
- 作者：Xiuwei Zhang;Bernard ME Moret
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
66.Phylogenetic comparative assembly

机译：系统发育比较装配
- 作者：Peter Husemann;Jens Stoye
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
67.Jane: a new tool for the cophylogeny reconstruction problem

机译：简：解决系统发生重建问题的新工具
- 作者：Chris Conow;Daniel Fielder;Yaniv Ovadia;Ran Libeskind-Hadas
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
68.Sparsification of RNA structure prediction including pseudoknots

机译：稀疏的RNA结构预测，包括假结
- 作者：Mathias M?hl;Raheleh Salari;Sebastian Will;Rolf Backofen;S Cenk Sahinalp
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
69.Mimosa: Mixture model of co-expression to detect modulators of regulatory interaction

机译：含羞草：共表达的混合物模型，用于检测调节相互作用的调节剂
- 作者：Matthew Hansen;Logan Everett;Larry Singh;Sridhar Hannenhalli
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
70.Differential co-expression framework to quantify goodness of biclusters and compare biclustering algorithms

机译：差分共表达框架可量化双聚簇的优度并比较双聚簇算法
- 作者：Burton KH Chia;R Krishna Murthy Karuturi
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
71.Back-translation for discovering distant protein homologies in the presence of frameshift mutations

机译：在存在移码突变的情况下进行反向翻译以发现遥远的蛋白质同源性
- 作者：Marta G?rdea;Laurent Noé;Gregory Kucherov
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
72.Sequence embedding for fast construction of guide trees for multiple sequence alignment

机译：序列嵌入可快速构建用于多序列比对的引导树
- 作者：Gordon Blackshields;Fabian Sievers;Weifeng Shi;Andreas Wilm;Desmond G Higgins
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
73.Constructing majority-rule supertrees

机译：构造多数规则超级树
- 作者：Jianrong Dong;David Fernández-Baca;FR McMorris
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
74.Robinson-Foulds Supertrees

机译：鲁滨逊福兹超级树
- 作者：Mukul S Bansal;J Gordon Burleigh;Oliver Eulenstein;David Fernández-Baca
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
75.On the use of cartographic projections in visualizing phylo-genetic tree space

机译：关于使用制图投影可视化系统发育树空间
- 作者：Kenneth Sundberg;Mark Clement;Quinn Snell
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
76.Inverse folding of RNA pseudoknot structures

机译：RNA假结结构的反向折叠
- 作者：James ZM Gao;Linda YM Li;Christian M Reidys
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
77.Association of repeatedly measured intermediate risk factors for complex diseases with high dimensional SNP data

机译：重复测量的复杂疾病的中间危险因素与高维SNP数据的关联
- 作者：Sandra Waaijenborg;Aeilko H Zwinderman
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
78.A simulation study comparing supertree and combined analysis methods using SMIDGen

机译：使用SMIDGen比较超级树和组合分析方法的仿真研究
- 作者：M Shel Swenson;Fran?ois Barban?on;Tandy Warnow;C Randal Linder
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
79.Polynomial algorithms for the Maximal Pairing Problem: efficient phylogenetic targeting on arbitrary trees

机译：最大配对问题的多项式算法：针对任意树的有效系统发育目标
- 作者：Christian Arnold;Peter F Stadler
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
80.Scoring function to predict solubility mutagenesis

机译：评分功能可预测溶解度诱变
- 作者：Ye Tian;Christopher Deutsch;Bala Krishnamoorthy
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
81.FlexSnap: Flexible Non-sequential Protein Structure Alignment

机译：FlexSnap：灵活的非顺序蛋白质结构比对
- 作者：Saeed Salem;Mohammed J Zaki;Chris Bystroff
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
82.Exact distribution of a pattern in a set of random sequences generated by a Markov source: applications to biological data

机译：马尔可夫源产生的一组随机序列中模式的精确分布：应用于生物学数据
- 作者：Gregory Nuel;Leslie Regad;Juliette Martin;Anne-Claude Camproux
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
83.Module detection in complex networks using integer optimisation

机译：使用整数优化的复杂网络中的模块检测
- 作者：Gang Xu;Laura Bennett;Lazaros G Papageorgiou;Sophia Tsoka
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
84.Fast prediction of RNA-RNA interaction

机译：快速预测RNA相互作用
- 作者：Raheleh Salari;Rolf Backofen;S Cenk Sahinalp
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
85.Optimal selection of epitopes for TXP-immunoaffinity mass spectrometry

机译：TXP免疫亲和质谱的表位的最佳选择
- 作者：Hannes Planatscher;Jochen Supper;Oliver Poetz;Dieter Stoll;Thomas Joos;Markus F Templin;Andreas Zell
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
86.Challenges in experimental data integration within genome-scale metabolic models

机译：基因组规模代谢模型中实验数据整合的挑战
- 作者：Pierre-Yves Bourguignon;Areejit Samal;Fran?ois Képès;Jürgen Jost;Olivier C Martin
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
87.A markov classification model for metabolic pathways

机译：代谢途径的Markov分类模型
- 作者：Timothy Hancock;Hiroshi Mamitsuka
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
88.Linear-time protein 3-D structure searching with insertions and deletions

机译：具有插入和缺失的线性时间蛋白质3-D结构搜索
- 作者：Tetsuo Shibuya;Jesper Jansson;Kunihiko Sadakane
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
89.Gravitation field algorithm and its application in gene cluster

机译：引力场算法及其在基因簇中的应用
- 作者：Ming Zheng;Gui-xia Liu;Chun-guang Zhou;Yan-chun Liang;Yan Wang
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
90.Periodic pattern detection in sparse boolean sequences

机译：稀疏布尔序列中的定期模式检测
- 作者：Ivan Junier;Joan Hérisson;Fran?ois Képès
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
91.A simple, practical and complete O-time Algorithm for RNA folding using the Four-Russians Speedup

机译：一种简单，实用且完整的O时间算法，使用四俄罗斯加速比进行RNA折叠
- 作者：Yelena Frid;Dan Gusfield
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
92.Accuracy of phylogeny reconstruction methods combining overlapping gene data sets

机译：结合重叠基因数据集的系统发育重建方法的准确性
- 作者：Anne Kupczok;Heiko A Schmidt;Arndt von Haeseler
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
93.Predicting direct protein interactions from affinity purification mass spectrometry data

机译：从亲和纯化质谱数据预测直接蛋白质相互作用
- 作者：Ethan DH Kim;Ashish Sabharwal;Adrian R Vetta;Mathieu Blanchette
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
94.Hierarchical folding of multiple sequence alignments for the prediction of structures and RNA-RNA interactions

机译：多重序列比对的分层折叠，用于预测结构和RNA-RNA相互作用
- 作者：Stefan E Seemann;Andreas S Richter;Jan Gorodkin;Rolf Backofen
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
95.An automated stochastic approach to the identification of the protein specificity determinants and functional subfamilies

机译：一种自动随机方法来鉴定蛋白质特异性决定因素和功能亚家族
- 作者：Pavel V Mazin;Mikhail S Gelfand;Andrey A Mironov;Aleksandra B Rakhmaninova;Anatoly R Rubinov;Robert B Russell;Olga V Kalinina
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
96.A tree-based method for the rapid screening of chemical fingerprints

机译：一种基于树的化学指纹快速筛选方法
- 作者：Thomas G Kristensen;Jesper Nielsen;Christian NS Pedersen
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
97.Survival associated pathway identification with group Lp penalized global AUC maximization

机译：Lp组惩罚性AUC最大化对生存相关途径的识别
- 作者：Zhenqiu Liu;Laurence S Magder;Terry Hyslop;Li Mao
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
98.Efficient algorithms for training the parameters of hidden Markov models using stochastic expectation maximization (EM) training and Viterbi training

机译：使用随机期望最大化（EM）训练和Viterbi训练来训练隐马尔可夫模型参数的高效算法
- 作者：Tin Y Lam;Irmtraud M Meyer
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2010年第1期
99.EUCALYPT: efficient tree reconciliation enumerator

机译：EUCALYPT：有效的树对帐枚举器
- 作者：Beatrice Donati;Christian Baudet;Blerina Sinaimeri;Pierluigi Crescenzi;Marie-France Sagot
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期
100.A graph modification approach for finding core–periphery structures in protein interaction networks

机译：在蛋白质相互作用网络中寻找核心-外围结构的图修饰方法
- 作者：Sharon Bruckner;Falk Hüffner;Christian Komusiewicz
- 期刊名称：《Algorithms for Molecular Biology》 | 2015年第1期

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