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白羽肉用种鸡遗传变异的RAPD分析

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第一章前言

1 RAPD标记技术

1.1 DNA标记技术的分类

1.2 PCR反应与RAPD标记技术

1.3 RAPD标记技术的优点与缺点

1.4 RAPD标记的可靠性问题与实验条件的优化

2 RAPD标记技术的应用

2.1 RAPD标记技术在遗传育种中的应用

2.2 RAPD标记技术在鸡遗传分析中的应用

3 RAPD标记技术的展望

4本课题研究的目的和意义

第二章材料与方法

1试验材料

1.1动物材料

1.2试剂与引物

1.3主要的实验仪器

2试验方法

2.1试验设计

2.2鸡血液DNA的提取

2.3鸡血细胞基因组DNA浓度和纯度的测定

2.4基因组DNA的完整性检测

2.5 RAPD实验程序

2.6数据处理与统计分析

第三章结果与分析

1鸡红细胞DNA基因组的质量检验

2优化后的RAPD反应条件的确定

3优化后RAPD反应体系的确定

4 RAPD-PCR扩增

5数据统计与分析

5.1品种间相似系数的计算与分析

5.2聚类分析

第四章讨论

1鸡血细胞基因组DNA的提取

2影响RAPD扩增的因素

3鸡血细胞基因组遗传多样性分析

第五章结论

参考文献

致 谢

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摘要

本试验旨在初步的探讨白羽肉用种鸡的遗传多样性研究及分子水平育种的初期工作,以收集的8个白羽肉用种鸡样品为试验材料,进行RAPD-PCR分子标记研究,探讨几个白羽肉用种鸡的分类和遗传多样性,得出的主要结论如下:
   1.模板DNA的质量是进行RAPD-PCR试验的关键,本试验中所提取的模板DNA质量较高,经检测适用于RAPD-PCR扩增。
   2.建立、优化了白羽肉用种鸡RAPD-PCR的反应体系和反应条件。在20μl反应体系中,rTaqDNA聚合酶的用量为1.5U,引物浓度为0.35μM,dNTPs的浓度为0.25mM,模板DNA浓度为40ng,10×PCR buffer2μl。按照此体系,在94℃预变性5min,94℃变性30s,在37℃下退火45s,72℃延伸90s,进行35个循环,循环结束后72℃延伸10min,4℃保存。该体系扩增出的条带清晰,效果良好,适宜用于RAPD分析。
   3.在供试的28个引物中,筛选出21个适合进行RAPD扩增的引物,对8份白羽肉用种鸡样品材料进行RAPD分析,共扩增出162个条带,其中多态性条带为114条,多态性比率为70.37%。
   4.依据RAPD扩增结果分析,供试8个样品的遗传相似系数在0.484-0.740之间。
   5.聚类图揭示了白羽肉用种鸡各样品间的遗传相似性,为以后更有目的、有选择的引种、育种、缩短育种年限、提高育种效率提供一定的参考。

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