2014年重庆地区儿童诺如病毒腹泻分子流行病学研究

摘要

目的：了解2014年重庆区域诺如病毒感染所致儿童急性腹泻的感染现状、临床特征、流行基因型以及发生基因重组情况。
　　方法：2014年1月至12月在重庆医科大学附属儿童医院门诊检验科收集符合纳入条件的腹泻标本511例，同时记录患儿的临床资料，用RT-PCR法分别对诺如病毒GI和GII基因组的衣壳蛋白（Capsid）区进行扩增，再对阳性PCR产物进行测序，并对序列进行基因分型及构建进化树；为进行重组分析，再次用RT-PCR法对NV阳性标本的部分RdRp区和Capsid区同时进行扩增，然后基因分型，如果RdRp区和Capsid区分型不一致则考虑基因重组，然后选取重组代表株用SimPlot再次进行鉴定。
　　结果：共收集到符合条件的标本511例（男290例，女221例），未检测出NV GI型，共检出NV GII型67例，检出率13.1％(67/511)，男性38例，阳性率为13.1％（38/290）,女性29例，阳性率为13.1％（29/221），男女NV检出率差异没有统计学意义（χ2=0．000，P>0．05）。除4月份外，其余各月份均有NV阳性，以8月至10月为检出高峰，不同月份间NV检出率差异有统计学意义（χ2=58.583，P<0．05）。NV阳性率最高的年龄组为7到12月龄，2岁以下儿童占其总检出例数的86.6％。NV阳性患儿中有36例伴有呕吐(36/67,53.7%），19例合并呼吸道症状（19/67,28.4%），此外还有7例患儿伴有发热（7/67,10.5%）。67例NV阳性标本在Capsid区测序成功，分型包括5种基因型，依次是GII.4 Sydney2012型42例（62.7%），GII.3型8例（11.9%）和GII.17型8例（11.9%），GII.6型7例（10.5%），GII.14型2例（3.0%）。59例NV病毒阳性标本同时在RdRp区和Capsid区测序成功，共检测到52例重组株，4种重组型别，分别是GII.e/GII.4 Sydney2012型42株、GII.12/GII.3型6株、GII.7/GII.6型2株、GII.7/GII.14型2株。
　　结论：诺如病毒是重庆区域小儿病毒性腹泻的常见病原，2014年检出率为13.1%，男女NV检出率无统计学差异。诺如病毒在重庆地区的流行高峰主要集中在8月至10月，检出率最高年龄组为7到12月龄，发病年龄以小于2岁的婴幼儿为主，呕吐为NV腹泻最常见的伴随症状。2014年重庆地区NV有5种流行基因型(按capsid区分型)， GII.4 Sydney2012为最主要的流行株，其次分别是GII.3，GII.17，GII.6和GII.14。2014年重庆地区NV重组现象十分明显，此次研究共检测到4种重组株，分别是GII.e/GII.4 Sydney2012、GII.12/GII.3、GII.7/GII.6、GII.7/GII.14。

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英汉缩略语名词对照

中文摘要

英文摘要

前言

1标本来源、材料与方法

1.1 标本来源

1.2 实验材料

1.2.1 所用仪器

1.2.2 所用试剂

1.3 实验方法

1.3.1 用RT-PCR法对诺如病毒进行基因检测

1.3.2 诺如病毒重组鉴定

2结果分析

2.1 诺如病毒感染情况

2.2 诺如病毒GII型Capsid区基因片段序列测定和基因型分析

2.3 重组分析

3讨论

全文总结

参考文献

文献综述:诺如病毒研究进展

致谢

攻读硕士学位期间论文发表情况