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第一章文献综述
1.1前言
1.2遗传连锁图谱的构建
1.2.1实验设计:参考家系
1.2.2遗传标记
1.2.3遗传图谱绘制方法
1.2.4遗传连锁图谱的性质
1.2.5牛遗传连锁图谱的构建
1.3放射杂交图谱
1.3.1 RH图谱的建立
1.3.2 RH图谱的应用
1.3.3牛的放射杂交图谱的构建
1.4物理图谱
1.4.1物理图谱的构建
1.4.2牛的基因组物理图谱研究进展
1.5比较基因组图谱
1.5.1比较作图方法
1.5.2牛比较图谱的研究进展
1.6 QTL定位
1.6.1 QTL定位的实验设计-资源家系
1.6.2 QTL定位方法
1.6.3牛产奶性状的QTL定位研究进展
第二章材料与方法
2.1实验材料
2.1.1实验动物
2.1.2性状的表型记录
2.1.3微卫星的选择
2.1.4主要试剂和溶液配置
2.1.5主要实验仪器
2.2实验方法
2.2.1牛全血(凝结血)基因组DNA的提取
2.2.2牛冻精基因组DNA的提取
2.2.3 PCR反应条件
2.2.4利用ABI377测序仪进行微卫星基因型的判定
2.2.5数据整理与统计分析
第三章QTL定位的数据准备—基因型、表型、系谱及遗传图谱数据
3.1微卫星基因型的检测
3.1.1基因组DNA样品的准备
3.1.2微卫星的PCR及电泳检测
3.1.3利用GENESCANTM3.0与GenotyperTM2.5完成微卫星分型和数据导出
3.1.4 14个已发表的和10个新发现的微卫星判型结果
3.2亲子关系的鉴定
3.3微卫星群体遗传参数评估
3.4微卫星图谱的绘制
3.4.1 14个已知标记连锁图谱的绘制
3.4.2四个新标记位置的确定
3.5个体表型育种值的估计
3.6结论
第四章QTL连锁定位的结果与分析
4.1基于MARC04图谱的QTL EXPRESS定位计算
4.1.1 26个家系间分析
4.1.2各性状显著家系间分析
4.1.3显著家系内分析
4.2基于MARC97图谱的QTL EXPRESS定位计算
4.2.1 26个家系间分析
4.2.2显著家系分析
4.3基于MARC04图谱的MQREML定位计算
4.4基于MARC97图谱的MQREML定位计算
4.5结论与讨论
4.5.1参照MARC04和MARC97图谱的结果比较
4.5.2 QTL Express和MQREML的结果比较
4.5.3 QTL定位结果与之前研究结果的比较
总结
参考文献
致谢
附录
个人简历