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全ゲノム解析を取リ入れた河川水中の薬剤耐性大腸菌の実態解明

机译:结合全基因组分析阐明河水中抗药性大肠杆菌的实际状况

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摘要

大腸菌は、感染症の原因菌として世界中で問題とな っており、臨床的にとても重要な細菌である。この問題 をさらに深刻にしているのが、抗生物質に耐性を示す 大腸菌の存在であり、近年では抗生物質使用頻度の増 加により、複数種の抗生物質に耐性を示す多剤耐性菌 の増加が問題となっている。また、これまでの研究から 環境水中にはこれらの薬剤耐性菌が存在することがわ かっている。河川水はレクリェーションや農業用水、水 道水源として使われることから、河川水中の薬剤耐性 菌の存在は、ヒトの健康リスクの増大に寄与すると考 えられている。しかし、臨床検体に由来する薬剤耐性菌 に関しては、詳細な遺伝学的知見は得られているもの の、河川水といった環境水中の薬剤耐性菌については、 遺伝学的知見は不足しているのが現状である。そこで 本研究では、河川水から単離した大腸菌を対象とし、全 ゲノム配列を決定することで、河川水中の薬剤耐性大 腸菌の詳細な遺伝学的知見を提供することを目的とし た。
机译:大肠杆菌是临床上重要的细菌,作为传染病的致病因素,它已成为世界范围的问题。进一步加剧该问题的是对抗生素具有抗性的大肠杆菌,并且近年来,抗生素使用频率的增加导致对多种类型的抗生素具有抗性的多药耐药性细菌的增加。这是一个问题。另外,迄今为止的研究表明,这些耐药细菌存在于环境水中。由于河水中用于娱乐,农业用水和水源,人们认为河水中存在耐药菌会导致人类健康风险的增加。然而,尽管已经获得了关于源自临床标本的抗药性细菌的详细的遗传学知识,但是对于诸如河水之类的环境水中的抗药性细菌的遗传学知识仍然不足。目前的情况。因此,在这项研究中,我们旨在通过靶向从河水中分离出的大肠杆菌并确定整个基因组序列,来提供河水中抗药性肠杆菌科的详细遗传知识。

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