フラグメント分子軌道法(FMO法)による一本鎖DNAと結合タンパク質の相互作用解析

摘要

フラグメント分子軌道法（FMO法[1])は、 巨大分子系の電子状態計算法で、特に分子間 相互作用に関して詳細なデータを得ることが できる。従来、二本鎖DNAやそのタンパク質 複合体のFMO計算が行われてきたが、今回は、 一本鎖DNA (single-stranded DNA, ssDNA)と タンパク質の複合体にFMOを適用した。