整合基因表达谱研究非可控性结肠炎恶性转化的调控网络

摘要

目的：自2002年系统生物学概念的提出,对生物医学传统的"单一疾病单一靶点"的研发模式产生了巨大的冲击与挑战.溃疡性结肠炎(Ulcerative colitis,UC)是常见的肠道炎症性疾病(inflammatory bowel disease,IBD) 并且与结直肠癌的发生密切相关.到目前为止,该病的发生机制仍然不清楚,随着基因表达谱数据的增加,采用网络生物学技术,整合来自于不同研究机构的多种研究,将有助于阐明该疾病可能的调控网络.rn 方法：首先通过整合几种基因芯片的研究结果，采用Empirical Bayes (EB)构建与结直肠癌发生相关的信号调控网络;进一步根据发表的数据库构建人类肿瘤的信号网络;最后根据共表达的差异基因构建与非可控性结肠炎个性变有关的多层信号网络。rn 结果：将信号网络分成四层，包括细胞外、膜、胞浆和核，然后鉴定了5个核心生物学过程，4个与结直肠癌相关的信号网络。结果强调了EGF/EGFR信号途径，EPO信号途径，T细胞信号转导和BCR成员的信号途径可能与结直肠炎的恶性转化有关。rn 结论：研究描述了整合多种芯片研究数据的方法;信号网络的构建是基于实验支持的;基于通路的分析阐明了与结直肠癌发生相关的信号调控网络，对于未来疾病的预防和干预有重要意义。