若干生物活性肽的QSAR研究与虚拟筛选

摘要

本文阐述了多肽定量构效关系和分子设计方法的最新进展,介绍了多肽定量构效关系研究中的化学结构定量描述符和建立数学模型的统计方法,并对模拟肽学和虚拟组合多肽库在多肽分子设计中的应用进行了简要的论述。同时建立了一套新型的氨基酸残基结构描述符C-scale,用此描述符进行多肽的定量构效关系研究。通过理论计算得出167个氨基酸结构描述参数,再对167个参数进行主成份分析,从中提取出与氨基酸残基的三维结构性质密切相关的三个结构描述参数C1、c2、c3-scales。然后采用G/PLS算法,建立氨基酸残基结构描述符c-scales与多肽生物活性之间的函数关系,确定多肽的QSAR模型。用此方法建立了苦味二肽、ACE抑制剂二肽和缓激肽增效剂五肽的QSAR模型,均有较好的拟合和预测能力,交叉验证相关系数和相关系数都在0.70以上,验证了计算方法的可靠性。