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Journal of chemical information and modeling

Journal of chemical information and modeling

SCIEIMEDLINECA

中文名称：化学信息与建模杂志

ISSN：1549-9596
出版周期：Bimonthly

发文量：3133

期刊论文

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1.Communication between the Ligand-Binding Pocket and the Activation Function-2 Domain of Androgen Receptor Revealed by Molecular Dynamics Simulations

机译：配体结合口袋与雄激素受体的活化功能-2结构域之间的通信，由分子动力学模拟显示
- 作者：Jin Ye;Duan Mojie;Wang Xuwen;Kong Xiaotian;Zhou Wenfang;Sun Huiyong;Liu Hui;Li Dan;Yu Huidong;Li Youyong;Hou Tingjun
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第2期
2.InsectiPAD: A Web Tool Dedicated to Exploring Physicochemical Properties and Evaluating Insecticide-Likeness of Small Molecules

机译：虫胶：致力于探索物理化学性质和评估小分子的杀虫剂的网页
- 作者：Jia Chen-Yang;Wang Fan;Hao Ge-Fei;Yang Guang-Fu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第2期
3.Hydration of Aromatic Heterocycles as an Adversary of pi-Stacking

机译：芳香杂环的水合作为PI堆叠的逆向
- 作者：Loeffler Johannes R.;Schauperl Michael;Liedl Klaus R.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
4.Virtual Screening of Novel Noncovalent Inhibitors for SARS-CoV 3C-like Proteinase

机译：用于SARS-COV 3C样蛋白酶的新型非共价抑制剂的虚拟筛选
- 作者：Zhenming Liu;Changkang Huang;Keqiang Fan;Ping Wei;Hao Chen;Shiyong Liu;Jianfeng Pel;Lei Shi;Bo Li;Kun Yang;Ying Liu;Luhua Lai
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第1期
5.TMB Library of Nucleosome Simulations

机译：TMB核心模拟库
- 作者：Sun Ran;Li Zilong;Bishop Thomas C.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
6.Coliiment on 'Evaluating Unexpectedly Short Non-covalent Distances in X-ray Crystal Structures of Proteins with Electronic Structure Analysis'

机译：“电子结构分析蛋白蛋白X射线晶体结构中意外短的非共价距离评价”
- 作者：Kruse Holger;Sponer Jiri;Auffinger Pascal
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第9期
7.NetInfer: A Web Server for Prediction of Targets and Therapeutic and Adverse Effects via Network-Based Inference Methods

机译：NetInfer：通过基于网络的推断方法预测目标和治疗性和不利影响的Web服务器
- 作者：Wu Zengrui;Peng Yayuan;Yu Zhuohang;Li Weihua;Liu Guixia;Tang Yun
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第8期
8.Self-Consistent Component Increment Theory for Predicting Enthalpy of Formation

机译：用于预测形成焓的自我一致的分量增量理论
- 作者：Zhao Qiyuan;Savoie Brett M.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第4期
9.Basin Hopping Genetic Algorithm for Global Optimization of PtCo Clusters

机译：PTCO集群全局优化的流域跳跃遗传算法
- 作者：Huang Rao;Bi Jian-Xiang;Li Lei;Wen Yu-Hua
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第4期
10.Impact of the Astaxanthin, Betanin, and EGCG Compounds on Small Oligomers of Amyloid A beta(40) Peptide

机译：虾青素，白桦和EGCG化合物对淀粉样蛋白β（40）肽的小低聚体的影响
- 作者：Huynh Minh Hung;Minh Tho Nguyen;Phuong-Thao Tran;Vi Khanh Truong;Chapman James;Le Huu Quynh Anh;Derreumaux Philippe;Vu Van V.;Son Tung Ngo
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
11.Highly Flexible Ligand Docking: Benchmarking of the DockThor Program on the LEADS-PEP Protein-Peptide Data Set

机译：高度灵活的配体对接：在铅-Pem蛋白 - 肽数据集上的船坞程序的基准测试
- 作者：Santos Karina B.;Guedes Isabella A.;Karl Ana L. M.;Dardenne Laurent E.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
12.Structure and Dynamics of the CRISPR-Cas9 Catalytic Complex

机译：CRISPR-CAS9催化复合物的结构和动力学
- 作者：Palermo Giulia
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
13.In Silico Prediction of Endocrine Disrupting Chemicals Using Single-Label and Multilabel Models

机译：在硅中的使用单标签和多函数模型预测内分泌扰乱化学品
- 作者：Lixia Sun;Hongbin Yang;Yingchun Cai;Weihua Li;Guixia Liu;Yun Tang
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第3期
14.Allosteric Control of N-Acetyl-Aspartate Hydrolysis by the Y231C and F295S Mutants of Human Aspartoacylase

机译：Y231C和人阿巴醇酸酯的y231C和F295S突变体对N-乙酰基 - 天冬氨酸水解的变构控制
- 作者：Kots Ekaterina D.;Khrenova Maria G.;Nemukhin Alexander V.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
15.Accurate Calculation of Barnase and SNase Folding Energetics Using Short Molecular Dynamics Simulations and an Atomistic Model of the Unfolded Ensemble: Evaluation of Force Fields and Water Models

机译：使用短分子动力学模拟和展开合奏的原子模型精确计算晶酶和Snase折叠能量：武力场和水模型评估
- 作者：Jose Galano-Frutos Juan;Sancho Javier
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
16.Computational Protocol for Assessing the Optimal Pixel Size to Improve the Accuracy of Single-particle Cryo-electron Microscopy Maps

机译：用于评估最佳像素尺寸以提高单粒子冷冻电子显微镜图谱的精度的计算协议
- 作者：Tiwari Sandhya P.;Chhabra Sahil;Tama Florence;Miyashita Osamu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第5期
17.Efficient and Accurate Hydration Site Profiling for Enclosed Binding Sites

机译：高效和准确的水化位点，用于封闭的结合位点
- 作者：Masters Matthew R.;Mahmoud Amr H.;Yang Ying;Lill Markus A.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第11期
18.How to Computationally Stack the Deck for Hit-to-Lead Generation: In Silico Molecular Interaction Energy Profiling for de Novo siRNA Guide Strand Surrogate Selection

机译：如何计算地堆叠甲板以获取击球发电：在硅分子交互能量分析中为De Novo siRNA引导链替代选择
- 作者：Greenidge Paulette A.;Blommers Marcel J. J.;Priestle John P.;Hunziker Jurg
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
19.NanoCrystal: A Web-Based Crystallographic Tool for the Construction of Nanoparticles Based on Their Crystal Habit (vol 58, pg 2380, 2018)

机译：纳米晶：基于Web的基础晶体工具，用于构建纳米粒子的晶体习性（Vol 58，PG 2380,2018）
- 作者：Chatzigoulas Alexios;Karathanou Konstantina;Dellis Dimitris;Cournia Zoe
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第4期
20.One Among Millions: The Chemical Space of Nucleic Acid-Like Molecules

机译：其中一个人：核酸样分子的化学空间
- 作者：Cleaves Henderson James II;Butch Christopher;Burger Pieter Buys;Goodwin Jay;Meringer Markus
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
21.Learning Coarse-Grained Potentials for Binary Fluids

机译：学习二元流体的粗粒潜力
- 作者：Gao Peiyuan;Yang Xiu;Tartakovsky Alexandre M.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第8期
22.QSPR Using MOLGEN-QSPR:The Challenge of Fluoroalkane Boiling Points

机译：QSPR使用Molgen-QSPR：氟代烷烃沸点的挑战
- 作者：Christoph Riicker;Markus Meringer;Adalbert Kerber
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第1期
23.Identification of a New Allosteric Binding Site for Cocaine in Dopamine Transporter

机译：鉴定多巴胺转运蛋白可卡因的新颠覆粘合位点
- 作者：Xu Liang;Chen Liao Y.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第8期
24.All-Assay-Max2 pQSAR: Activity Predictions as Accurate as Four-Concentration IC(50)s for 8558 Novartis Assays

机译：All-Assay-MAX2 PQSAR：活动预测，作为四浓度IC（50）的四分：8558 Novartis测定
- 作者：Martin Eric J.;Polyakov Valery R.;Zhu Xiang-Wei;Tian Li;Mukherjee Prasenjit;Liu Xin
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
25.FINDSITEcomb2.0: A New Approach for Virtual Ligand Screening of Proteins and Virtual Target Screening of Biomolecules

机译：findsitecomb2.0：蛋白质的虚拟配体筛选的新方法和生物分子的虚拟目标筛选
- 作者：Zhou Hongyi;Cao Hongnan;Skolnick Jeffrey
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第11期
26.Limitations of Ligand-Only Approaches for Predicting the Reactivity of Covalent Inhibitors

机译：用于预测共价抑制剂的反应性的仅配体的局限性
- 作者：Voice Angus;Tresadern Gary;van Vlijmen Herman;Mulholland Adrian
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
27.Macrocycle Cell Permeability Measured by Solvation Free Energies in Polar and Apolar Environments

机译：通过极性和非极性环境中的溶剂化能量测量宏细胞细胞渗透性
- 作者：Kamenik Anna S.;Kraml Johannes;Hofer Florian;Waibl Franz;Quoika Patrick K.;Kahler Ursula;Schauperl Michael;Liedl Klaus R.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第7期
28.A Discussion of Measures of Enrichment in Virtual Screening:Comparing the Information Content of Descriptors with Increasing Levels of Sophistication

机译：探讨虚拟筛选中丰富措施的探讨：比较描述符的信息含量随着复杂程度的增加
- 作者：Andreas Bender;Robert C.Glen
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第5期
29.Building Highly Reliable Quantitative Structure-Activity Relationship Classification Models Using the Rivality Index Neighborhood Algorithm with Feature Selection

机译：建立高度可靠的定量结构 - 活动关系分类模型，使用具有特征选择的招生指数邻域算法
- 作者：Luque Ruiz Irene;Angel Gomez-Nieto Miguel
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
30.Fantastic Liquids and Where To Find Them: Optimizations of Discrete Chemical Space

机译：梦幻般的液体以及在哪里找到它们：优化离散化学空间
- 作者：Beckner Wesley;Pfaendtner Jim
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第6期
31.Large-Scale Parallel Implementation of Hartree-Fock Exchange Energy on Real-Space Grids Using 3D-Parallel Fast Fourier Transform

机译：使用3D平行快速傅里叶变换进行大规模并行实现Hartree-Fock Exchange能量的实际网格中的能量
- 作者：Takahashi Hideaki;Sakuraba Shun;Morita Akihiro
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
32.Robust Classification of High-Dimensional Spectroscopy Data Using Deep Learning and Data Synthesis

机译：使用深度学习和数据合成的高尺寸光谱数据的鲁棒分类
- 作者：Houston James;Glavin Frank G.;Madden Michael G.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第4期
33.Chemical Space and Diversity of the NuBBE Database: A Chemoinformatic Characterization

机译：Nubbe数据库的化学空间和多样性：化学信息表征
- 作者：Saldivar-Gonzalez Fernanda I.;Valli Marilia;Andricopulo Adriano D.;Bolzani Vanderlan da Silva;Medina-Franco Jose L.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第1期
34.A Multiscale Model for the Self-Assembly of Coat Proteins in Bacteriophage MS2

机译：噬菌体MS2中外套蛋白自组装的多尺度模型
- 作者：Wang Bo;Zhang Junjie;Wu Yinghao
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第9期
35.CRISPro: An Automated Pipeline for Protein Conformation Stabilization by Proline

机译：Crispro：脯氨酸蛋白质构象稳定的自动化管道
- 作者：Rawi Reda;Shen Chen-Hsiang;Kwong Peter D.;Chuang Gwo-Yu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第11期
36.Fatty Acid and Retinol-Binding Protein: Unusual Protein Conformational and Cavity Changes Dictated by Ligand Fluctuations

机译：脂肪酸和视黄醇结合蛋白：具有配体波动规定的异常蛋白质构象和腔变化
- 作者：Barletta G. P.;Franchini G.;Corsico B.;Fernandez-Alberti S.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第8期
37.Anion Effect on Gas Absorption in Imidazolium-Based Ionic Liquids

机译：基于咪唑鎓离子液体气体吸收的阴离子影响
- 作者：Neumann Jesse G.;Stassen Hubert
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
38.Using Membrane Partitioning Simulations To Predict Permeability of Forty-Nine Drug-Like Molecules

机译：使用膜分区模拟来预测四十九种药物的渗透性
- 作者：Dickson Callum J.;Hornak Viktor;Bednarczyk Dallas;Duca Jose S.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第1期
39.Medicinal Chemists versus Machines Challenge: What Will It Take to Adopt and Advance Artificial Intelligence for Drug Discovery?

机译：药用化学家对机器挑战：采用和推进人工智能进行药物发现需要什么？
- 作者：Zhavoronkov Alex
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第6期
40.Are the Apo Proteins Suitable for the Rational Discovery of Allosteric Drugs?

机译：APO蛋白质是适合于颠覆药物的理性发现吗？
- 作者：An Xiaoli;Lu Shaoyong;Song Kun;Shen Qiancheng;Huang Meilan;Yao Xiaojun;Liu Huanxiang;Zhang Jian
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第1期
41.CoMFA,CoMSIA,and Molecular Hologram QSAR Studies of Novel Neuronal nAChRs Ligands-Open Ring Analogues of 3-Pyridyl Ether

机译：COMFA，COMSIA和分子全息图QSAR研究新型神经元NACHRS配体 - 开环3-吡啶基醚
- 作者：Huabei Zhang;Hua Li;Chunping Liu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第2期
42.GEMS-Pack: A Graphical User Interface for the Packmol Program

机译：Gems-Pack：Packmol程序的图形用户界面
- 作者：Silva Lucas A.;Correia Julio C. G.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
43.Virtual Screening of Hole Transport, Electron Transport, and Host Layers for Effective OLED Design

机译：虚拟筛选空穴传输，电子传输和主机层，用于有效OLED设计
- 作者：Shao-Yu Lu;Sukrit Mukhopadhyay;Robert Froese;Paul M. Zimmerman
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第12期
44.Structure-Based Drug Design of Diphenyl α?Aminoalkylphosphonates as Prostate-Specific Antigen Antagonists

机译：基于结构的二苯基αβαβααβαα氨基烷基膦酸酯作为前列腺特异性抗原拮抗剂
- 作者：Arben Kojtari;Vishal Shah;Jacob S. Babinec;Catherine Yang;Hai-Feng Ji
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2014年第10期
- Structure;
- Drug;
- Design;
45.Doping Effects on the Performance of Paired Metal Catalysts for the Hydrogen Evolution Reaction

机译：对氢进化反应成对金属催化剂性能的掺杂作用
- 作者：Hunter Michelle A.;Fischer Julia M. T. A.;Hankel Marlies;Yuan Qinghong;Searles Debra J.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
46.Structure-Based Classification of Chemical Reactions without Assignment of Reaction Centers

机译：基于结构的化学反应分类而不分配反应中心
- 作者：Qing-You Zhang;Joao Aires-de-Sousa
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第6期
47.Discovery of Low Micromolar Dual Inhibitors for Wild Type and L1196M Mutant of Anaplastic Lymphoma Kinase through Structure-Based Virtual Screening

机译：基于结构的虚拟筛选发现野生型和L1196M突变酶的低微摩尔双抑制剂的发现
- 作者：Shin Saemina;Mah Shinmee;Hong Sungwoo;Park Hwangseo
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2016年第4期
48.ZINClick v.18: Expanding Chemical Space of 1,2,3-Triazoles

机译：Zinclick V.18：扩大1,2,3-三唑的化学空间
- 作者：Levre Doriana;Arcisto Chiara;Mercalli Valentina;Massarotti Alberto
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
49.Consensus versus Individual QSARs in Classification: Comparison on a Large-Scale Case Study

机译：与分类中的个人QSARS共识：大规模案例研究比较
- 作者：Valsecchi Cecile;Grisoni Francesca;Consonni Viviana;Ballabio Davide
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
50.Establishing a Framework of Using Residue-Residue Interactions in Protein Difference Network Analysis

机译：建立蛋白质差网络分析中残留残基相互作用的框架
- 作者：Yao Xin-Qu;Momin Mohamed;Hamelberg Donald
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第7期
51.Generalizable Framework for Algorithmic Interpretation of Thin Film Morphologies in Scanning Probe Images

机译：扫描探针图像中薄膜形态的算法解释概括框架
- 作者：Tatum Wesley K.;Torrejon Diego;ONeil Patrick;Onorato Jonathan W.;Resing Anton B.;Holliday Sarah;Flagg Lucas Q.;Ginger David S.;Luscombe Christine K.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第7期
52.A Distance-Based Boolean Applicability Domain for Classification of High Throughput Screening Data

机译：基于距离的布尔适用性域，用于分类高吞吐量筛选数据
- 作者：Berenger Francois;Yamanishi Yoshihiro
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第1期
53.SPRESIweb 2.1,a Selective Chemical Synthesis and Reaction Database

机译：SpresiWeb 2.1，一种选择性化学合成和反应数据库
- 作者：Dana L.Roth
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第5期
54.Universal Activation Index for Class A GPCRs

机译：A类GPCR的通用激活索引
- 作者：Ibrahim Passainte;Wifling David;Clark Timothy
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第9期
55.Structural Approach To Identify a Lead Scaffold That Targets the Translesion Synthesis Polymerase Rev1

机译：鉴定靶向翻塑合成聚合酶Rev1的铅支架的结构方法
- 作者：Dash Radha Charan;Ozen Zuleyha;Rizzo Alessandro A.;Lim Socheata;Korzhnev Dmitry M.;Hadden M. Kyle
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第11期
56.Theoretical Investigation of Steric Effect Influence on Reactivity of Substituted Butadienes with Bromocyclobutenone

机译：与溴氰酸苯胺酮的取代丁烯反应性的理论研究
- 作者：Adilakshmi Arumugam;Kumar Madhu Deepan;Jaccob Madhavan;Tamilmani Venkatachalam
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第5期
57.Quantitative Prediction of Hemolytic Toxicity for Small Molecules and Their Potential Hemolytic Fragments by Machine Learning and Recursive Fragmentation Methods

机译：通过机器学习和递归碎片方法定量预测小分子对小分子的溶血性毒性及其潜在溶血
- 作者：Zheng Suqing;Xiong Jun;Wang Yibing;Liang Guang;Xu Yong;Lin Fu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第6期
58.Identification of Target Associations for Polypharmacology from Analysis of Crystallographic Ligands of the Protein Data Bank

机译：从蛋白质数据库晶体配体分析中鉴定POMPralacology的靶缔组态
- 作者：Pinzi Luca;Rastelli Giulio
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
59.Multi-Objective Genetic Algorithm (MOGA) As a Feature Selecting Strategy in the Development of Ionic Liquids’ Quantitative Toxicity–Toxicity Relationship Models

机译：多目标遗传算法（MOGA）作为离子液体定量毒性毒性关系模型开发的特征选择策略
- 作者：Maciej Barycki;Anita Sosnowska;Karolina Jagiello;Tomasz Puzyn
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第12期
60.Multiscale Modeling of Thiol Overoxidation in Peroxiredoxins by Hydrogen Peroxide

机译：过氧化氢过氧毒素硫醇过氧化的多尺度建模
- 作者：Semelak J. A.;Battistini F.;Radi R.;Trujillo M.;Zeida A.;Estrin D. A.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
61.Propagation of Conformational Coordinates Across Angular Space in Mapping the Continuum of States from Cryo-EM Data by Manifold Embedding

机译：构象坐标在通过歧管嵌入映射从Cryo-EM数据映射映射状态的角度空间的传播
- 作者：Maji Suvrajit;Liao Hstau;Dashti Ali;Mashayekhi Ghoncheh;Ourmazd Abbas;Frank Joachim
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第5期
62.Molecular Insight into the Interaction between Camptothecin and Acyclic Cucurbit[4]urils as Efficient Nanocontainers in Comparison with Cucurbit[7]uril: Molecular Docking and Molecular Dynamics Simulation

机译：与葫芦（CuCurbit [7] Uril）相比，分子见解Camptothecin和无环葫芦[4]尿嘧啶的相互作用[4]尿嘧啶：分子对接和分子动力学模拟
- 作者：Ahmadian Nasim;Mehrnejad Faramarz;Amininasab Mehriar
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
63.Understanding the Contributions of Microscopic Heat Transfer to Thermal Conductivities of Liquid Aldehydes and Ketones by Molecular Dynamics Simulation

机译：通过分子动力学模拟理解微观传热对液体醛和酮的热导体的贡献
- 作者：Yang Fan;Lu Haixia;Liu Wanqiang;Zhou Hu
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第6期
64.Deep Learning and Random Forest Approach for Finding the Optimal Traditional Chinese Medicine Formula for Treatment of Alzheimer's Disease

机译：深度学习和随机森林方法，用于寻找阿尔茨海默病治疗最佳中药公式
- 作者：Chen Hsin-Yi;Chen Jian-Qiang;Li Jun-Yan;Huang Hung-Jin;Chen Xi;Zhang Hao-Ying;Chen Calvin Yu-Chian
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第4期
65.Revealing Molecular Determinants of hERG Blocker and Activator Binding

机译：揭示Herg阻滞剂和活化剂结合的分子测定
- 作者：Dickson Callum J.;Velez-Vega Camilo;Duca Jose S.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
66.HybridMolDB: A Manually Curated Database Dedicated to Hybrid Molecules for Chemical Biology and Drug Discovery

机译：HybridMoldb：手动策划数据库，专门用于化学生物学和药物发现的混合分子
- 作者：Li Yecheng;Zhao Chongze;Zhang Jianhua;Zhai Shiyang;Wei Boyan;Wang Ling
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
67.A Computational Approach to the Study of the Binding Mode of S1P(1)R Agonists Based on the Active-Like Receptor Model

机译：基于活性的受体模型的S1P（1）r激动剂的结合模式研究的计算方法
- 作者：Chen Yonghui;Liu Tianqi;Xi Qiumu;Jia Wenqiang;Yin Dali;Wang Xiaojian
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第4期
68.Kinase Activation by Small Conformational Changes

机译：通过小构象变化激活激酶激活
- 作者：Lopez Elias D.;Burastero Osvaldo;Arcon Juan P.;Defelipe Lucas A.;Ahn Natalie G.;Marti Marcelo A.;Turjanski Adrian G.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
69.Prediction of the Rodent Carcinogenicity of 60 Pesticides by the DEREKfW Expert System

机译：Derekfw专家系统预测60种农药的啮齿动物致癌性
- 作者：Pierre Crettaz;Romualdo Benigni
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2005年第6期
70.Integrated Binary QSAR-Driven Virtual Screening and In Vitro Studies for Finding Novel hMAO-B-Selective Inhibitors

机译：集成二元QSAR驱动的虚拟筛选和寻找新型HMAO-B选择性抑制剂的体外研究
- 作者：Is Yusuf Serhat;Aksoydan Busecan;Senturk Murat;Yurtsever Mine;Durdagi Serdar
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第8期
71.Free Energies of the Disassembly of Viral Capsids from a Multiscale Molecular Simulation Approach

机译：来自多尺度分子模拟方法的病毒衣壳拆卸的自由能量
- 作者：Martinez Matias;Cooper Christopher D.;Poma Adolfo B.;Guzman Horacio V
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第2期
72.Accurate Prediction of Biological Assays with High-Throughput Microscopy Images and Convolutional Networks

机译：具有高吞吐学显微镜图像和卷积网络的生物测定准确预测
- 作者：Markus Hofmarcher;Elisabeth Rumetshofer;Djork-Arné Clevert;Sepp Hochreiter;Günter Klambauer
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第3期
73.Binding Residence Time through Scaled Molecular Dynamics: A Prospective Application to hDAAO Inhibitors

机译：通过缩放分子动力学的结合停留时间：Hdaao抑制剂的前瞻性应用
- 作者：Bernetti Mattia;Rosini Elena;Mollica Luca;Masetti Matteo;Pollegioni Loredano;Recanatini Maurizio;Cavalli Andrea
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第11期
74.Binding Interactions of Ergotamine and Dihydroergotamine to 5-Hydroxytryptamine Receptor 1B (5-HT1b) Using Molecular Dynamics Simulations and Dynamic Network Analysis

机译：使用分子动力学模拟和动态网络分析将奥替胺和二氢酮胺与5-羟基--Tryptamine受体1B（5-HT1B）的结合相互作用
- 作者：Sullivan Holli-Joi;Tursi Amanda;Moore Kelly;Campbell Alexandra;Floyd Cecilia;Wu Chun
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
75.Off-Pocket Activity Cliffs: A Puzzling Facet of Molecular Recognition

机译：脱袋活动悬崖：分子识别的令人费解的方面
- 作者：Abramyan Tigran M.;An Yi;Kireev Dmitri
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
76.Quantitative Characterization of Binding Pockets and Binding Complementarity by Means of Zernike Descriptors

机译：通过Zernike描述符的结合袋和结合互补性的定量表征
- 作者：Di Rienzo Lorenzo;Milanetti Edoardo;Alba Josephine;DAbramo Marco
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
77.Halogen Bonds in Ligand-Protein Systems: Molecular Orbital Theory for Drug Design

机译：配体 - 蛋白质系统中的卤素键：药物设计的分子轨道理论
- 作者：Margiotta Enrico;van der Lubbe Stephanie C. C.;Santos Lucas de Azevedo;Paragi Gabor;Moro Stefano;Bickelhaupt F. Matthias;Guerra Celia Fonseca
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
78.Faces of Contemporary CryoEM Information and Modeling

机译：当代Cryoem信息和建模的面孔
- 作者：Palermo Giulia;Sugita Yuji;Wriggers Willy;Amaro Rommie E.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第5期
79.Predicting Positions of Bridging Water Molecules in Nucleic Acid-Ligand Complexes

机译：预测桥接水分子在核酸 - 配体络合物中的位置
- 作者：Wei Wanlei;Luo Jiaying;Waldispuhl Jerome;Moitessier Nicolas
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第6期
80.Arylamide as Potential Selective Inhibitor for Matrix Metalloproteinase 9 (MMP9): Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Molecular Modeling

机译：芳基酰胺作为基质金属蛋白酶9（MMP9）的潜在选择性抑制剂：设计，合成，生物学评估和分子建模
- 作者：Hariono Maywan;Nuwarda Rina F.;Yusuf Muhammad;Rollando Rollando;Jenie Riris I.;Al-Najjar Belal;Julianus Jeffry;Putra Kevin C.;Nugroho Ervan S.;Wisnumurti Yohanes K.;Dewa Sangga P.;Jati Benedictus W.;Tiara Reynaldo;Ramadani Ratna D.;Qodria Lailatul;Wahab Habibah A.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
81.In Silico Identification of a Key Residue for Substrate Recognition of the Riboflavin Membrane Transporter RFVT3

机译：在核蛋白膜转运蛋白膜覆盖物RFVT3的底物识别的硅鉴定中的硅鉴定
- 作者：Dilly Sebastien;Garnier Melanie;Sole Marion;Bailly Remi;Taib Nada;Bestel Isabelle
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
82.DNA Structural Distortions Induced by a Monofunctional Trinuclear Platinum Complex with Various Cross-Links Using Molecular Dynamics Simulation

机译：通过使用分子动力学模拟的单官能三核铂复合物的单官能三核铂复合物诱导的DNA结构扭曲
- 作者：Li Chaoqun;Zhao Xiaojia;Liu Wei;Yin Fangqian;Hu Junping;Zhang Guangjie;Chen Guangju
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
83.Identification of Bioisosteric Substituents by a Deep Neural Network

机译：深神经网络鉴定生物脑内取代基
- 作者：Ertl Peter
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第7期
84.BIreactive: A Machine-Learning Model to Estimate Covalent Warhead Reactivity

机译：双重反应：一种估计共价弹头反应性的机器学习模型
- 作者：Palazzesi Ferruccio;Hermann Markus R.;Grundl Marc A.;Pautsch Alexander;Seeliger Daniel;Tautermann Christofer S.;Weber Alexander
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第6期
85.Enhanced Sampling Simulations of Ligand Unbinding Kinetics Controlled by Protein Conformational Changes

机译：增强蛋白质构象变化控制的配体脱界动力学的抽样模拟
- 作者：Zhou Yang;Zou Rongfeng;Kuang Guanglin;Angstrom Bengt;Halidin Christer;Agren Hans;Tu Yaoquan
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第9期
86.Unraveling the Modulation of the Activity in Drugs Based on Methylated Phenanthroline When Intercalating between DNA Base Pairs

机译：在DNA碱对嵌入时基于甲基化菲咯啉的药物中的药物活性的调节
- 作者：Gil Adria;Sanchez-Gonzalez Angel;Branchadell Vicenc
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第9期
87.Machine-Learning-Based Cyclic Voltammetry Behavior Model for Supercapacitance of Co-Doped Ceria/rGO Nanocomposite

机译：基于机器学习的循环伏安法行为模型，具有共掺杂的Ceria / Rgo纳米复合材料的超级电容
- 作者：Shaikh Parwaiz;Owais Ahmed Malik;Debabrata Pradhan;Mohammad Mansoob Khan
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2018年第12期
88.Exploring Ligand Stability in Protein Crystal Structures Using Binding Pose Metadynamics

机译：使用粘合姿态MEADADADAMICS探索蛋白质晶体结构中的配体稳定性
- 作者：Fusani Lucia;Palmer David S.;Somers Don O.;Wall Ian D.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第3期
89.De Novo Molecule Design by Translating from Reduced Graphs to SMILES

机译：通过从减少的图形翻译以微笑来微笑De Novo分子设计
- 作者：Peter Pogány;Navot Arad;Sam Genway;Stephen D. Pickett
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第3期
90.Clustering Enhancement of Noisy Cryo-Electron Microscopy Single-Particle Images with a Network Structural Similarity Metric

机译：具有网络结构相似度量的噪声冷冻电子显微镜单粒图像的聚类增强
- 作者：Yin Shuo;Zhang Biao;Yang Yang;Huang Yan;Shen Hong-Bin
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第4期
91.On the Thermal Stability of O-6-Methylguanine-DNA Methyltransferase from Archaeon Pyrococcus kodakaraensis by Molecular Dynamics Simulations

机译：通过分子动力学模拟从Archaeon Pyrococccus kodakarensis的O-6-甲基胍胺-DNA甲基转移酶的热稳定性
- 作者：Lopez-Chavez Erick;Perez-Hernandez Gerardo;Aparicio Felipe;Alas Salomon J.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第4期
92.d-SEAMS: Deferred Structural Elucidation Analysis for Molecular Simulations

机译：D-接缝：分子模拟的延迟结构阐明分析
- 作者：Goswami Rohit;Goswami Amrita;Singh Jayant K.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第4期
93.Engineering a Histone Reader Protein by Combining Directed Evolution, Sequencing, and Neural Network Based Ordinal Regression

机译：通过组合定向的演化，测序和基于神经网络的序数回归来工程组蛋白阅读器蛋白
- 作者：Parkinson Jonathan;Hard Ryan;Ainsworth Richard I;Li Nan;Wang Wei
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第8期
94.Impact of the Journal of Chemical Information and Modeling Special Issue on Women in Computational Chemistry

机译：化学信息杂志及对妇女在计算化学中的影响影响
- 作者：Mazzolari Angelica;Nunes-Alves Ariane;Wahab Habibah A.;Amaro Rommie E.;Cournia Zoe;Merz Kenneth M. Jr.
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第7期
95.Insights into the Mechanisms of the Pyrazinamide Resistance of Three Pyrazinamidase Mutants N11K, P69T, and D126N

机译：探讨三种吡嗪酰胺酶突变体N11K，P69T和D126N的吡嗪酰胺抗性的机制
- 作者：Junaid Muhammad;Khan Muhammad Tahir;Malik Shaukat Iqbal;Wei Dong-Qing
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第1期
96.Atomic Decomposition Scheme of Noncovalent Interactions Applied to Host-Guest Assemblies

机译：应用于托管 - 访客组件的非共价交互原子分解方案
- 作者：Ponce-Vargas Miguel;Lefebvre Corentin;Boisson Jean-Charles;Henon Eric
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第1期
97.Systematic Exploration of Protein Conformational Space Using a Distance Geometry Approach

机译：利用距离几何法对蛋白质构象空间进行系统探索
- 作者：Malliavin Therese E.;Mucherino Antonio;Lavor Carlile;Liberti Leo
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第10期
98.Exploring the Pyrazinamide Drug Resistance Mechanism of Clinical Mutants T370P and W403G in Ribosomal Protein S1 of Mycobacterium tuberculosis

机译：探索临床突变体T370P和W403G的吡嗪酰胺耐药机制，结核分枝杆菌核糖体蛋白S1
- 作者：Rehman Ashfaq Ur;Khan Muhammad Tahir;Liu Hao;Wadood Abdul;Malik Shaukat Iqbal;Chen Hai-Feng
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第4期
99.Iterative Screening Methods for Identification of Chemical Compounds with Specific Values of Various Properties

机译：迭代筛选方法，用于鉴定具有各种性质的特异性值的化学化合物
- 作者：Miyao Tomoyuki;Funatsu Kimito
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2019年第6期
100.Coarse-Grained Diffraction Template Matching Model to Retrieve Multiconformational Models for Biomolecule Structures from Noisy Diffraction Patterns

机译：粗粒衍射模板匹配模型，用于检索噪声衍射图案的生物分子结构的多模型模型
- 作者：Tokuhisa Atsushi;Kanada Ryo;Chiba Shuntaro;Terayama Kei;Isaka Yuta;Ma Biao;Kamiya Narutoshi;Okuno Yasushi
- 期刊名称：《Journal of chemical information and modeling》 | 2020年第6期

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