两株猪细小病毒分离株的分子特征分析

摘要

猪细小病毒在临床上出现了一些新的特征，为了解猪细小病毒在我国的遗传变异情况，本文应用PcR方法对两株猪细小病毒现地分离株BQ株和ZJ株进行了基因组测序，并结合已经报道的若干国内猪细小病毒序列和国外代表株序列做了相关分析。测序结果表明猪细小病毒BQ株和ZJ株基因组全长分别为5013nt和5031nt，其编码区序列均不存在碱基的插入与缺失，但在VP1/VP2终止密码子处的非编码区存在不同程度的碱基缺失，分别缺少63和45个碱基，推测可能与毒力变化有关。根据VP2蛋白的多序列比对结果以及VP2蛋白215位、378位、383位、436位和565位等关键氨基酸位点的变异情况，发现猪细小病毒感染的临床病理型(生物型)与VP2蛋白这些关键氨基酸位点的改变密切相关。遗传进化分析表明，我国猪细小病毒的演化主要发生基因漂移，其对抗原性的影响需要进一步研究。