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一种基于二代测序的PEDV病毒基因组分析方法

摘要

本发明公开了一种基于二代测序的PEDV病毒基因组分析方法,其特征在于,包括如下步骤:下载宿主猪的基因组序列和转录本序列,作为宿主参考序列;获得去宿主污染的测序序列;拼接基因组;将基因组进行同源比对;挑选比对结果;将比对的起始位点作为基因的起始位点。本发明与现有技术相比,能够准确预测出基因结构,避免遗漏。

著录项

  • 公开/公告号CN111199772B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2023.05.23

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 上海派森诺生物科技股份有限公司;

    申请/专利号CN201911381880.0

  • 发明设计人 崔天一;孙子奎;

    申请日2019.12.27

  • 分类号G16B20/00(2019.01);G16B30/00(2019.01);

  • 代理机构上海天翔知识产权代理有限公司 31224;

  • 代理人吕伴

  • 地址 200030 上海市徐汇区银都路218号2号楼1、2层

  • 入库时间 2023-06-26 18:42:11

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