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基于机器学习筛选细菌耐药表型相关重要特征基因的方法

摘要

本申请涉及一种基于机器学习技术筛选细菌耐药表型相关重要特征基因的方法,该方法针对细菌抗生素耐药表型,基于BGWAS思想搜集公共平台上目标细菌基因组或者现行收集测序组装后得到的大样本量菌株基因组数据及其对应的抗生素药物药敏测试结果,使用机器学习方法进行基因型与耐药表型两者间关联分析,以筛选出与耐药表型相关的重要特征基因(非核心耐药基因),同时得到重要特征基因的权重系数,最后使用ROC分析确定各药物相关耐药基因可靠性。

著录项

  • 公开/公告号CN114067912B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2022-06-17

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 天津金匙医学科技有限公司;

    申请/专利号CN202111400540.5

  • 申请日2021-11-23

  • 分类号G16B30/10;G16B30/20;G16B50/00;G16B40/00;G16H70/40;G06N20/00;

  • 代理机构北京知汇林知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人董涛

  • 地址 301799 天津市武清区武清开发区福源道北侧创业总部基地B21号楼901室

  • 入库时间 2022-08-23 13:51:24

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2022-03-08

    实质审查的生效 IPC(主分类):G16B30/10 专利申请号:2021114005405 申请日:20211123

    实质审查的生效

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