一种花生全基因组SNP开发的方法

摘要

本发明涉及一种花生全基因组SNP开发的方法，该方法包括标准数据分析和高级信息分析，标准数据分析包括构建基本信息和质量过滤，高级信息分析包括全基因组范围SNP筛查和分型分析、关联分析、亲本纯合位点在子代中偏分离结果和GWAS和偏分离结果一致性分析，该方法选择合适的限制性内切酶消化花生基因组，将酶切片段所对应的序列作为整个基因组序列的部分代表，从而降低了基因组的复杂性，并且成本低，尤其对于重复序列高、基因组信息相对匮乏的四倍体花生栽培种，通过开发全基因组SNP，有助于构建高密度遗传连锁图、基因的精细定位和分子标记辅助选择，也使得低成本快速有效的ＳＮＰ分型成为可能。