一种基于HRM的水稻全基因组SNP标记开发的方法及应用

摘要

本发明提供了一种基于HRM的水稻全基因组SNP标记开发的方法及应用，涉及分子标记开发技术领域。本发明利用水稻SNP信息数据库HapRice以及RICE6K，挖掘基于HRM技术的全基因组SNP分子标记。利用本发明所述方法开发出599个基于HRM技术的SNP分子标记，并构建覆盖水稻12条染色体的HRM‑SNP分子标记图谱，该图谱标记密度达到1.60个SNP/Mb，任一SNP标记至少在2个实验材料之间表现有多态性，利用该套标记将一个斑点叶基因Spl32(t)定位于水稻第11号染色体的22.35Mb～24.07Mb之间。