GenBank中花生栽培种基因组DNA及EST序列的SNP分析

摘要

下载GenBank数据库中已公布的花生栽培种基因组DNA序列1 718条及EST序列85 797条,利用DNAStar软件进行叠连群构建,基因组DNA序列构建叠连群161个,长度共计152 940bp,直接鉴定出候选SNP位点5 496个,SNP平均出现频率为3.59%;EST序列构建10 990个叠连群,长度共计10 477 241bp,由三条及三条序列以上构成的叠连群的总长度为6 524 329bp,发现候选SNP位点307 179个,SNP平均出现频率为4.71%.