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一种细胞基因翻译过程建模方法

摘要

本发明涉及一种细胞基因翻译过程建模方法,包括以下步骤:根据物种的实验数据得到每一个基因在每一个离散时间点该基因是否表达;查询每个离散时间点的基因,如果基因表达,则初始化;否则不进行初始化;通过各时间点上各基因对应的mRNA拷贝数量与前一个时间点上mRNA数量对比得到各种mRNA中初始化的数量;计算mRNA分子的总初始化速度;计算核糖体分子在对应mRNA上的总延伸速度;根据总初始化速度和总延伸速度得到事件的概率;根据事件概率的权重,随机选择一个事件;更新各种分子的状态。本发明采用基于完全不对称简单排斥过程的原理,同时考虑基因的表达动态变化,使得翻译过程呈现出时间序列特征,更接近细胞发育的本质,适合研究细胞动态发育性质。

著录项

  • 公开/公告号CN106897578B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-02-14

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 中国科学院大连化学物理研究所;

    申请/专利号CN201510933552.2

  • 发明设计人 李国辉;张鼎林;赵然;

    申请日2015-12-15

  • 分类号

  • 代理机构沈阳科苑专利商标代理有限公司;

  • 代理人许宗富

  • 地址 116023 辽宁省大连市中山路457号

  • 入库时间 2022-08-23 10:50:17

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2020-02-14

    授权

    授权

  • 2017-07-21

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/12 申请日:20151215

    实质审查的生效

  • 2017-07-21

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/12 申请日:20151215

    实质审查的生效

  • 2017-06-27

    公开

    公开

  • 2017-06-27

    公开

    公开

  • 2017-06-27

    公开

    公开

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