基于联合约束非负矩阵分解的差异表达基因辨识方法

摘要

本发明公开一种基于联合约束非负矩阵分解的差异表达基因辨识方法。1.用非负矩阵X表示癌症基因表达数据集；2.构造对角矩阵Q和元素全1矩阵E；3.在经典的非负矩阵分解方法中引入流形学习，对系数矩阵G施加正交约束稀疏和约束，得到联合约束非负矩阵分解目标函数；4.求解此目标函数，得到基矩阵F和系数矩阵G的迭代公式；5.对非负数据集X进行半监督非负矩阵分解，迭代收敛后得到基矩阵F和系数矩阵G；6.根据基矩阵F得到评估向量对评估向量中的元素从大到小进行排序，得到差异表达基因；7.通过GO工具对辨识的差异表达基因进行检测分析。本发明能够有效提取癌症数据集中的差异表达基因，能用于发现人类疾病基因数据库中的差异特征，对癌症的早期诊断和针对性治疗有重要的临床意义。