联合约束非负矩阵分解方法研究及在组学数据中的应用

目录

声明

第1章 绪论

1.1 研究背景和意义

1.1.1 研究背景

1.1.2 研究意义

1.2 国内外研究综述

1.3 论文主要工作

1.3.1研究内容

1.3.2数据集

1.3.3论文的组织结构

第2章 多约束非负矩阵分解方法

2.1 引言

2.2 方法介绍

2.2.1 NMF方法理论概述

2.2.2 MCNMF方法

2.2.3 更新规则

2.2.4时间复杂度和框架

2.3 实验

2.3.1数据集

2.3.2 实验设置

2.3.3.收敛性分析

2.4 结果与讨论

2.4.1评价指标

2.4.2聚类分析

2.4.3共差异表达基因选择

2.4.4通路分析

2.5 本章小结

第3章 有监督超图非负矩阵分解方法

3.1 引言

3.2 方法介绍

3.2.1 HDNMF方法

3.2.2 更新规则

3.2.3 时间复杂度

3.3 实验

3.3.1数据集

3.3.2 实验设置

3.3.3收敛性分析

3.4 结果与讨论

3.4.1分类分析

3.4.2 共差异表达基因选择

3.4.3通路分析

3.5 本章小结

第4章 整合鲁棒图正则非负矩阵分解方法

4.1 引言

4.2 方法介绍

4.2.1 iRGNMF方法

4.2.2更新规则

4.2.3 时间复杂度

4.3 实验

4.3.1 数据集

4.3.2 收敛性分析

4.3.3 参数选择

4. 4 实验结果与讨论

4.4.1评价指标

4.4.2聚类分析

4.4.3网络分析

4.5 本章小结

第5章 深半非负矩阵分解方法

5.1 引言

5.2 方法介绍

5.2.1 深半NMF方法

5.2.2更新规则

5.3 实验

5.3.1 数据集

5.3.2 参数选择

5.3.3 收敛性分析

5.4 结果与讨论

5.4.1 评价指标

5.4.1聚类分析

5.4.2 共差异表达基因选择

5.5 本章小结

第6章 稀疏深半非负矩阵分解方法

6.1 引言

6.2 方法介绍

6.2.1 SCDSMF方法

6.2.2更新规则

6.2.3时间复杂度

6.3 实验

6.3.1 数据集

6.3.2 参数选择

6.3.3 收敛性分析

6.4 实验结果与讨论

6.4.1 评价指标

6.4.2 聚类分析

6.4.3 共差异表达基因选择

6.5 本章小结

第7章 总结与展望

7.1 总结

7.2 展望

参考文献

在读期间发表的学术论文及研究成果

致谢