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一种基于跨平台基因表达数据的基因调控网络重建方法

摘要

本发明涉及一种基于跨平台基因表达数据的基因调控网络重建方法,根据跨平台基因表达数据的特点,通过获取来自p个测序平台基因表达数据,并进行预处理,然后从每个基因样本中抽取n个基因表达量,并基于偏相关系数的混合型条件独立性测试得到每个基因表达量的父子节点集,将其应用于跨平台因果网络结构学习的学习网络骨架、确定v‑结构和最大化标志方向三个过程中,从而重建出跨平台基因调控网络,本发明利用因果图模型解决跨平台基因调控网络的问题,能直接有效地利用跨平台基因表达数据进行高维的基因调控网络重建的同时,避免数据预处理过程导致的数据过度平滑等问题,提高了跨平台基因调控网络重建结果的正确率和召回率。

著录项

  • 公开/公告号CN107016260B

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2019-09-13

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广东工业大学;

    申请/专利号CN201710201797.5

  • 申请日2017-03-30

  • 分类号

  • 代理机构广州市红荔专利代理有限公司;

  • 代理人吝秀梅

  • 地址 510006 广东省广州市番禺区广州大学城外环西路100号

  • 入库时间 2022-08-23 10:39:49

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2019-09-13

    授权

    授权

  • 2017-08-29

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F19/20 申请日:20170330

    实质审查的生效

  • 2017-08-29

    实质审查的生效 IPC(主分类):G06F 19/20 申请日:20170330

    实质审查的生效

  • 2017-08-04

    公开

    公开

  • 2017-08-04

    公开

    公开

  • 2017-08-04

    公开

    公开

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