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一种基于跨平台因果网络结构的基因调控网络重建方法

摘要

本发明公开了一种基于跨平台因果网络结构的基因调控网络重建方法,包括:基于连续型因果网络结构建立离散型的平台节点,得到跨平台网络结构骨架;基于学习算法对所述跨平台网络结构骨架进行学习,对每个变量直接相连的变量集中的节点进行连接,得到无向图;在所述无向图中确定所述跨平台网络结构骨架中存在的v‑结构,得到部分有向图;根据约束规则最大化标记所述部分有向图中剩余的无向边,得到最大化标志方向的有向图;本发明将基因调控网络视作因果图,基因测序平台视作因果图上的一个特殊节点,在重建跨平台基因调控网络过程中,将平台变量加入每一个基因表达的调控变量集中,以此消除不同基因测序平台引起的差异影响。

著录项

  • 公开/公告号CN111653309A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2020-09-11

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 广州数锐智能科技有限公司;

    申请/专利号CN202010397581.2

  • 发明设计人 李弘;张金喜;曾晓南;

    申请日2020-05-12

  • 分类号G16B5/00(20190101);G16B25/00(20190101);G16B45/00(20190101);

  • 代理机构44202 广州三环专利商标代理有限公司;

  • 代理人郭浩辉;麦小婵

  • 地址 510000 广东省广州市天河区龙洞山庄大街22号601房

  • 入库时间 2023-06-19 08:14:27

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