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A scalable algorithm for structure identification of complex gene regulatory network from temporal expression data

机译:基于时态表达数据的复杂基因调控网络结构识别的可扩展算法

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摘要

BackgroundGene regulatory interactions are of fundamental importance to various biological functions and processes. However, only a few previous computational studies have claimed success in revealing genome-wide regulatory landscapes from temporal gene expression data, especially for complex eukaryotes like human. Moreover, recent work suggests that these methods still suffer from the curse of dimensionality if a network size increases to 100 or higher.
机译:背景基因调节相互作用对于各种生物学功能和过程至关重要。然而,只有少数先前的计算研究声称成功地从时态基因表达数据揭示了全基因组调控态势,特别是对于人类等复杂的真核生物而言。而且,最近的工作表明,如果网络规模增加到100或更大,这些方法仍然会遭受维度的诅咒。

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