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一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用

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本发明公开了一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用。本发明的基因组合物包括基因SNX3、AKIRIN2、TMEM87B、STEAP3、PPME1、LGALS7B、ARFRP1、STX11、RP11‑295P9.3和RP11‑434D12.1。本发明运用LASSO回归(套索回归)和二分类Logistic回归筛选与肠道菌群占比相关的基因，并构建评分Score，通过ROC曲线分析得到食管癌中对应评分的截断值，可用于食管癌患者相关肠道菌群的占比的推测。本发明基于基因组合物构建的评分模型经验证，具有准确性高，特异性好的优点，有很好的应用前景。

著录项

公开/公告号CN113789396A

专利类型发明专利
公开/公告日2021-12-14

原文格式PDF
申请/专利权人复旦大学附属中山医院;
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申请/专利号CN202111078574.7
发明设计人杨蕙沁;胥丰恺;金星;程涛;张欢;詹成;古杰;葛棣;
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申请日2021-09-15
分类号C12Q1/689(20180101);G16B40/00(20190101);G16H50/70(20180101);G16H50/20(20180101);C12R1/01(20060101);
代理机构31001 上海申汇专利代理有限公司;
代理人翁若莹
地址 200032 上海市徐汇区医学院路136号
入库时间 2023-06-19 13:43:30

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1. 一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用 [P] . 中国专利： CN113789396A . 2021-12-14
2. 3D数字PCR检测EGFR特定基因突变的引物探针组合物、试剂盒及方法 [P] . 中国专利： CN107488728A . 2017-12-19
3. Combination, composition, device, and methods for detecting differential expression of one or more genes, to measure the effect of a test substance on the expression of one or more genes and a method for screening a test substance to formulate a prognosis, to manipulate the genom To a human or animal not the expression of the genome of an animal.To modulate the expression of one or more genes differentially expressed, to choose an animal for inclusion in one or more groups, and to produce an antibody, substance, transgenic animal, the computer system, isolated and purified antibody, kit, medium to communicate information. And uses of data and data of polinucleotu00ecdeo prognosticators [P] . BRPI0708488A2 . 2011-05-31

机译：用于检测一种或多种基因差异表达，测量受试物质对一种或多种基因表达的影响的组合，组合物，装置和方法，以及用于筛选预后，操纵预后的方法基因组（genom）对人类或动物而言，而不是动物基因组的表达。调节一种或多种差异表达基因的表达，选择一种或多种动物，并产生抗体，物质，转基因动物，计算机系统，分离和纯化的抗体，试剂盒，用于传达信息的介质。数据和polinucleot u00ecdeo预后者的数据的使用
4. The purified enzyme termoestavel, encoder interface gene of enzyme, plasmidio selected, bactereofogo, structure of the enzyme is stable.Process for amplifying at least a sequence specific nucleic acid, a process to detect the presence or absence of at least one sequence specific nucleic acid.Process for detecting the presence or absence of at least one change of the nucleotideos in sequence in one or more nucleic acids.Process for cloning vector for cloning one or more specific sequences of nucleic acid and nucleic acid sequence amplified [P] . BR8704332A . 1988-04-19

机译：纯化的酶termoestavel，酶的编码器接口基因，质粒选择的，细菌的fogofogo，酶的结构是稳定的。扩增至少一种序列特异性核酸的方法，检测至少一种序列特异性核酸的存在或不存在的方法检测一种或多种核酸中至少一个核苷酸序列变化的存在或不存在的方法克隆载体的方法，用于克隆一种或多种核酸的特定序列和扩增的核酸序列
5. Polinucleotu00ecdios and polipeptu00ecdios isolated plant cells, transgenic plants, construction of DNA, wood, wood pulp, microconjunto,Combinations for detection of the expression of one or more genes, kit and methods for modification of the phenotype of a plant, production of transformed plant, wood and wood pulp,Correlation of expression of the gene in two different samples.The possession of a phenotype of plant with the level of expression of the gene in the plant of one or more genes and the propensity for the formation of reaction wood and detection of one or more genes in a sample. [P] . BRPI0411028A . 2006-07-25

机译：多聚核苷酸和多聚核苷酸分离的植物细胞，转基因植物，DNA，木材，木浆，微结缔的构建，用于检测一种或多种基因表达的组合，用于修饰植物表型的试剂盒和方法，生产转化植物，木材和木浆的特性，两个不同样品中基因表达的相关性。植物表型的存在与该基因在植物中一个或多个基因表达水平的关系以及形成植物的倾向反应木和样品中一个或多个基因的检测。