使用均聚物折叠测序读段改进对齐

摘要

本公开提供了用于解析长且高度相似但不相同的基因组区域以提高组装质量，尤其是多倍体基因组的组装质量的方法、组合物和计算机实施的过程等等。本公开的方面涉及使用均聚物折叠序列读段的精确字符串匹配来确定两个序列是否重叠并因此代表相同的基因组区域(例如，多倍体基因组中的相同单倍型)或序列是否代表不同的基因组区域。