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确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用

摘要

本发明涉及基因测序领域,具体涉及一种确定核酸样本中CNV的方法、装置及应用。所提供的方法包括:(1)获取核酸样本的测序数据;(2)基于测序数据,利用CNV检测软件,确定由多个初始CNV构成的初始CNV集合;(3)针对每个初始CNV,确定分类特征;(4)基于每个初始CNV的分类特征,利用预先构建的机器学习模型,对所述初始CNV集合进行筛选,以便获得最终CNV集合,所述分类特征为测序深度、GC含量、CNV类型、长度等多个特征中的至少一种。引入机器学习模型,并基于不同分类特征对初始CNV集合进行筛选,能够很好的排除人工筛选所引入的误差。而且只需要使用单个软件检测即可,最大程度保留了真实的CNV。

著录项

  • 公开/公告号CN113496761A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-12

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 深圳华大生命科学研究院;

    申请/专利号CN202010261297.2

  • 发明设计人 王泰福;周青;孙井花;王文婧;

    申请日2020-04-03

  • 分类号G16B30/10(20190101);G16B35/00(20190101);G06N20/00(20190101);G06N3/00(20060101);

  • 代理机构11201 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人张立

  • 地址 518083 广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼

  • 入库时间 2023-06-19 12:51:29

法律信息

  • 法律状态公告日

    法律状态信息

    法律状态

  • 2023-09-19

    授权

    发明专利权授予

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