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一种基于纳米孔测序仪的细菌测序数据鉴定方法

摘要

本发明公开了一种基于纳米孔测序仪的细菌测序数据鉴定方法,属于基因检测分析领域,鉴定方法包括:构建用于Nanopore测序数据比对的细菌序列参考库;将待测样品测序,用minimap2和blast两种比对软件进行数据库比对;注释结果,筛选比对结果,以barcode为单位进行汇总;对每一个barcode的比对结果进行分析,确定每一个细节比对结果的准确性;采用本发明的鉴定方法能够提高序列质量和分析速度,降低错误率。

著录项

  • 公开/公告号CN113470752A

    专利类型发明专利

  • 公开/公告日2021-10-01

    原文格式PDF

  • 申请/专利权人 杭州圣庭医疗科技有限公司;

    申请/专利号CN202110678809.X

  • 申请日2021-06-18

  • 分类号G16B30/10(20190101);G16B50/00(20190101);C12Q1/6869(20180101);

  • 代理机构33217 杭州华鼎知识产权代理事务所(普通合伙);

  • 代理人魏亮

  • 地址 311113 浙江省杭州市余杭区良渚街道通运街362号11幢301室

  • 入库时间 2023-06-19 12:46:51

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