一种基于基因组信息预测微卫星PCR产物特异性的方法

摘要

本发明公开一种基于基因组信息预测微卫星PCR产物特异性的方法，首先将基因组的序列存贮在一个单独的字典当中；再定义反向互补序列的函数方法；再根据设定好的参数，提取出4种形式的引物3’端碱基序列；再依据步骤四的序列，分别匹配出引物的4种形式在基因组上所有存在的位点；再罗列出第一种形式和第二种形式所有的组合，同时进一步罗列出第三种形式和第四种形式；最后根据设定好的参数，筛选出以上所有满足条件的基因组区域，这些区域为扩增出的PCR产物实际序列，从而进行后续的特异性评估；该方法实现了自动化的上下游引物在基因组中的条件性匹配，并进行特异性评估，对微卫星引物的筛选及物种亲子鉴定评估具有指导意义。