从二代测序数据挖掘植物ITSs序列并用于鉴别品种家系

摘要

本发明提供了一种通过二代测序数据准确组装个体内ITS不同单倍型的方法,包含以下步骤：1)制备待测样本总DNA的二代测序文库；2)将所述二代测序文库进行测序，得到测序数据；3)将所述测序数据分别进行ITS1、ITS2序列拼接和注释。本发明还公开了该方法组装得到的ITSs序列。本发明还提供了进一步的应用，包括使用该ITSs序列及对应的叶绿体基因组序列作为指纹鉴别样本的家系。对食用玫瑰，本专利能够直观的判断食用玫瑰品种的双亲来源及食用玫瑰品种之间的遗传关系，不仅能够准确快速鉴定品种及家系，还能为待测品种的育种途径和可能的改良方向提供重要的指导信息。