提取β-CD主客体体系代表性构象的MD/QM/CSM方法

摘要

本发明公开了一种提取β‑CD主客体体系代表性构象的MD/QM/CSM方法。所述方法包括：(1)计算主体分子的拓扑结构和RESP电荷；(2)计算客体分子的拓扑结构和RESP电荷；(3)构建主客体复合物的初始构象；(4)筛选主客体复合物、主体分子和客体分子的优势构象；(5)对主客体复合物优势构象进行ECD计算，与ICD实验相对照，确定筛选结构的准确性；(6)将主客体复合物、主体分子和客体分子的优势构象共采用QM/CSM方法计算包合自由能，计算值与实验值进行线性相关性分析。本发明能准确的提取主客体复合体系的代表性构象，为包合自由能计算提供了准确的结构模型，同时计算了真空中的包合自由能和溶剂效应，使主客体体系包合自由能的计算更为完善，为实验提供指导。