基于高通量测序技术的基因组代谢模型构建、优化及可视化的方法

摘要

本发明公开了一种基于高通量测序技术的基因组代谢模型构建、优化及可视化的方法，将高通量测序领域中I l l umi na二代测序和PacB i o三代测序技术相结合，优势互补地进行基因组拼接和注释，并在此基础上通过注释的蛋白质信息比对生物代谢通路数据库KEGG和MetaCyc,依据蛋白质对应的基因,进而根据基因‑酶‑反应的关联获取到全基因组规模代谢网络模型；并进一步寻找KEGG数据库中已有亲缘物种的代谢网络模型,通过基因同源比对亲缘模型的整合策略构建了相对精准的基因组规模代谢网络模型GEMs，实现流程自动化并生成相关结果报告文件。本发明基于基因组序列注释和代谢生化信息整合的基因组规模代谢网络模型GEMs的构建将有助于加快改造微生物。